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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS做分子动力学模拟时水分子模拟之后变形了
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流光634

新虫 (小有名气)

[求助] MS做分子动力学模拟时水分子模拟之后变形了

如图，做了水滴在经过烷烃修饰的蒙脱石（疏水性）上的扩散润湿模拟，但是模拟之后水分子变形了，且所有氧原子都朝下，做了好几次都是这个结果，不知道是不是因为力场分配出问题了？求教各位前辈。

MS做分子动力学模拟时水分子模拟之后变形了


MS做分子动力学模拟时水分子模拟之后变形了-1


MS做分子动力学模拟时水分子模拟之后变形了-2


@smutao 发自小木虫Android客户端
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1楼 2022-05-05 16:10:37
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月只蓝

主管区长 (职业作家)
推测力场和电荷设置的问题
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流光634
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
2楼2022-05-05 16:18:33
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流光634

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2022-05-05 16:18:33
推测力场和电荷设置的问题

谢谢！我也是这样认为的，就是不知道怎么解决，我用的蒙脱石是粘土矿物材料，请问是需要对每个原子手动分配力场吗？

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3楼2022-05-05 17:14:59
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@hubao

新虫 (小有名气)
很正常，一般是电荷设置有问题

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流光634
4楼2022-05-05 17:22:58
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流光634

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by @hubao at 2022-05-05 17:22:58
很正常，一般是电荷设置有问题

你好，请问能指教一下这种该怎么设置吗？新手真的快哭了

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5楼2022-05-05 20:00:16
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