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冬瓜太郎1996

新虫 (初入文坛)

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[交流] 在超算上安装ATAT-VASP接口常见问题以及解决办法已有2人参与

1、.ezvasp.rc文件的配置方法：（标准例子）
#!/bin/csh
#enter name of vasp executable here
（ ·这里的意思是填写超算上安装vasp的位置，最终要落到具体的版本上，vasp分三个版本：std、gamma和非线性版本，一般选择std就可以；
·另外需要注意的是要选择在VASP/安装包路径/bin文件夹下的，一定要选bin，不要选其他的；
·所有的路径要带引号）
set VASPCMD="/opt/pub/softwares/VASP/5.4.4-gzbuild/bin/vasp_std"
#enter the directories containing the pseudopotentials here

set POTLDA="~/bin/USPP_LDA/USPP_LDA"
set POTGGA="~/bin/USPP_GGA/USPP_PW91"
set POTPAWLDA="~/bin/PAW_LDA/PAW_LDA"
set POTPAWGGA="~/bin/PAW_GGA_pw91/PAW_PW91"
set POTPAWPBE="~/bin/pbe54"
这里需要把五种赝势库的路径都写上去，其实在vasp.wrap文件中指定了pawpbe，也就是说ATAT做计算的时候其实默认用PBE54赝势的，但是如果没有把五种赝势库的位置都告诉软件，软件就会报错。

2、一定要注意，将路径添加到.ezvasp.rc以后，同时也要将vasp_std和五个赝势库的路径也添加到环境变量（~/bin下的.bashrc文件)，如下：
# .bashrc

# Source global definitions
if [ -f /etc/bashrc ]; then
. /etc/bashrc
fi

# User specific environment
if ! [[ "$PATH" =~ "$HOME/.local/bin:$HOME/bin:" ]]
then
PATH="$HOME/.local/bin:$HOME/bin:$PATH"
fi
export PATH

# Uncomment the following line if you don't like systemctl's auto-paging feature:
# export SYSTEMD_PAGER=
export PATH=:~/bin/ATAT/atat:$PATH
export PATH=:~/bin/ATAT/ATAT_files:$PATH
export PATH=:~/bin/ATAT/atat/bin:$PATH
export PATH=:~/bin/pbe54:$PATH
export PATH=:~/bin/USPP_LDA/USPP_LDA:$PATH
export PATH=:~/bin/USPP_GGA/USPP_PW91:$PATH
export PATH=:~/bin/PAW_LDA/PAW_LDA:$PATH
export PATH=:~/bin/PAW_GGA_pw91/PAW_PW91:$PATH
export PATH=:/opt/pub/softwares/VASP/5.4.4-gzbuild/build/std/vasp:$PATH

然后source .bashrc保存，否则不会生效

3、如果ezvasp和环境变量都配置好了，在runstruct_vasp之前，需要先module load VASP，否则仍然会出现以下报错：
cp: cannot stat 'OSZICAR': No such file or directory
cp: cannot stat 'OUTCAR': No such file or directory
cp: cannot stat 'CONTCAR': No such file or directory
cp: cannot stat 'CONTCAR': No such file or directory
cp: cannot stat 'OSZICAR': No such file or directory
cp: cannot stat 'OUTCAR': No such file or directory
cp: cannot stat 'CONTCAR': No such file or directory
cp: cannot stat 'DOSCAR': No such file or directory
unable to open OSZICAR or OSZICAR.static

出现这个报错的原因是打开vasp失败，导致无法生成这些文件。前面1、2步是为了让ATAT可以找到vasp在哪里，第三步是激活打开vasp，这三点注意了就可以成功！

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