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guosy1999木虫 (正式写手)
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【求助】NVT系综下动力学平衡、均方位移的紊乱
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在用MS中的discover模块计算动力学均方位移时,步长1fs,动力学时间1500ps,平衡时间500ps,温控方法为Nose法。。动力学之前结构已minimizer过了,但是anaylsis时,MSD曲线呈现波浪式变化(如附件图),没有一点直线的迹象。。该怎么办呢?是由于动力学没有达到平衡吗?该改变什么参数。。谢谢! [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 10:10 ] |
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guosy1999
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2楼2009-09-10 16:07:58
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