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ayst_1

新虫 (小有名气)

[求助] MS中NPT使用求助

求大神指点。我想做在0.06MPa下，油分子靠近膜表面时与膜表面的作用能(实验是在一个密闭容器)。
我的做法是：将优化的油和膜放在同一个盒子，优化，退火(Quench选的NVT)，最后Energy。后来觉得有0.06MPa的外压，应该用NPT吧。
请问NPT应该怎么用？或者前面的步骤有没有问题？本人新手，一点NPT就显示failed。。按文本提示改了可能存在的问题依旧failed。。求各位大佬给一个详细点的指导。
谢谢！

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1楼 2022-04-15 22:46:26
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天天进步啊

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by ayst_1 at 2022-04-17 21:46:48
按照报错提示更改了参数，还是failed，不会用这个软件。。求大佬指点迷津

...

1、模型不合理，你再检查模型估计也检查不出什么来
2、从结果看就是 Andersen thermostat 出了错，你调一下相关参数
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分子筛、分子动力学模拟，有问题可咨询我的知乎主页 https://www.zhihu.com/people/rao777
4楼2022-04-17 22:02:00
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ayst_1

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 天天进步啊 at 2022-04-17 20:01:19
报错信息贴出来

按照报错提示更改了参数，还是failed，不会用这个软件。。求大佬指点迷津
MS中NPT使用求助



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3楼2022-04-17 21:46:48
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ayst_1

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 天天进步啊 at 2022-04-17 22:02:00
1、模型不合理，你再检查模型估计也检查不出什么来
2、从结果看就是 Andersen thermostat 出了错，你调一下相关参数...

我在Dynamics用NPT跑了下，压力设的0.06MPa，但是最后给的结果压力好大，请问这个怎么调啊，太难了。。
还有请问这个密度是取final值还是average？谢谢！！！
MS中NPT使用求助-1



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5楼2022-04-19 21:38:27
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ayst_1

新虫 (小有名气)
有大佬可以解答一下疑惑吗。谢谢

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6楼2022-04-25 15:49:05
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