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双一流南京医科大学曹晨课题组招生物信息（计算机）方向22年9月入学博士生
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南京医科大学是国家“双一流”建设高校，首批教育部、国家卫生健康委与江苏省人民政府共建医学院校，江苏高水平大学建设高峰计划a类建设高校。 曹晨，1988年，2022年2月年起任南京医科大学生物医学工程与信息学院教授，南京医科大学高层次引进人才，博士生导师，2016年计算机专业博士毕业，2017-2021年加拿大计算机（生物信息）方向博士后。 我主要从事研究方向是生物信息（计算生物），利用计算机算法/统计方法开发生物信息软件/工具以及对医学数据进行生物信息分析，希望你有科研热情和编程能力，背景可以是统计、计算机编程、机器学习；或者背景为生物信息（生物分析）。 希望你： 有算法和统计基础，或者本硕为生物信息分析方向； 英语过关，能独立撰写论文； 发表过论文； 对科研有追求。 我的邮箱： chen.cao at ucalgary.ca (注：把at替换为@，删除空格，防止垃圾邮箱) 我的近三年第一作者/通讯作者论文 [1] cao c, he j, mak l, perera d, kwok d, wang j, li m, mourier t, gavriliuc s, greenberg m, morrissy s, sycuro l, yang g, jeffares d, long q. reconstruction of microbial haplotypes by integration of statistical and physical linkage in scaffolding, molecular biology and evolution. 2021. doi: 10.1093/molbev/msab037. (if= 16.2, 中科院一区期刊) [2] cao c, ding b, li q, kwok d, wu j, long q. power analysis of transcriptome-wide association study: implications for practical protocol choice. plos genetics. 2021. doi: 10.1371/journal.pgen.1009405. (自然指数期刊) [3] cao c, wang j, devin k, cui f, zhang z, zhao d, li j, zou q. webtwas: a resource for disease candidate susceptibility genes identified by transcriptome-wide association study. nucleic acids research. 2022. doi: https://doi.org/10.1093/nar/gkab957 (if= 17.0, 中科院一区期刊) [4] cao c, mak l, jin g, gordon p, ye k, long q, presm: personalized reference editor for somatic mutation discovery in cancer genomics. bioinformatics. 2019. doi: 10.1093/bioinformatics/bty812. (中科院一区期刊) [5] cao c, kwok d, edie s, li q, ding b, kossinna p, campbell s, wu j, greenberg m, long q. ktwas: integrating kernel machine with transcriptome-wide association studies improves statistical power and reveals novel genes. briefings in bioinformatics. 2020. doi: 10.1093/bib/bbaa270. (if =11.1, 中科院一区期刊) [6] cao c, kossinna p, kwok d, qingrun zhang, long q. disentangling genetic feature selection and aggregation in transcriptome-wide association studies[j]. genetics. 2022. doi: 10.1093/genetics/iyab216. (1916 年创刊的遗传学经典期刊，2022年2月封面论文) [7] cao c, greenberg m, long. wglink: reconstructing whole-genome viral haplotypes using l0+l1-regularization. bioinformatics. 2021. doi: 10.1093/bioinformatics/btab076. (中科院一区期刊) [8] wei x, wu x, cheng z, wu q, cao c*, xu x*, shang h*, botanical drugs: a new strategy for structure-based target prediction. briefings in bioinformatics. 2021. doi: 10.1093/bib/bbab425. (*共同通讯，if =11.1, 中科院一区期刊) |
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