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学术衣冠

木虫 (正式写手)

[求助] 难道Bioanalyzer能够一次定量所有样品中小分子核酸的大小吗 已有1人参与

最近在看一个外文文献,主题是提供一种通过裂解植物材料、调节PH从而提取小分子RNA的方法,为了证明提取的核酸里只有RNA不含DNA,验证方法是采用Bioanalyzer分别对添加DNA酶前后的提取液进行RNA定量, DNA酶处理前后定量曲线没有变化则证明没有DNA。译文如下:
为了显现DNA酶作用之后对照溶液和根据实施例3的提取物的概况,在用DNA酶处理之前和之后用  定量小RNA。用或不用DNA酶处理植物提取物的情况下获得的概况是相同的,量保持相同或近似30mg/kg,如图3 中所示。向每个分析都添加内部标记物(图3 中在4nt的峰),并充当用于验证分析的正确运行的内部对照。

用DNA酶(特异性降解DNA而不是RNA的酶)测试表明根据实施例3的提取物的核酸在用DNA酶处理之后仍然存在。因此其实际上是RNA,特别是具有150个核苷酸的最大长度的低分子量RNA,而不是DNA。

没有接触过Bioanalyzer,但查询到Bioanalyzer分析RNA和DNA是不同的芯片,采用的是不同的试剂盒。我的理解是:由于定量小RNA时无法检测DNA,那么无论处理前后的提取液DNA是否降解, 定量小RNA的结果都应该没有变化。也就是说文献的这种Bioanalyzer定量RNA的方式无法证明提取液中是否含有DNA。

疑问: 难道Bioanalyzer能够一次定量所有样品中小分子核酸的大小吗。还是RNA和DNA必须采用不同芯片分别测量。

@biostar2009 @wizardfan 发自小木虫IOS客户端
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shuaibia6

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
Bioanalyzer的本质是电泳,所以它能同时观测不同大小的片段。根据信号的强弱对比标准的ladder也能确定浓度。DNA和RNA可以用不同的染料区分。至于文献是什么意思自己理解吧。像这种试剂和仪器类的原理什么的完全可以找商家的销售问的,他们一般都会很积极的跟你们说的
2楼2022-04-15 15:48:11
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