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Nature（IF 49.962）| 肠菌-免疫：炎症性肠病中真菌菌株多样性的免疫调节作用
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真菌组是肠道微生物组中不可忽视的成员，在包括炎症性肠病（IBD）在内的多种疾病中，都发现了肠道真菌组成的变化。然而，真菌组对宿主健康的影响及其作用机制我们仍然知之甚少。2022年3月美国康奈尔大学Iliev教授等人继于Cell期刊上发表“黏膜真菌通过17型免疫促进肠道屏障功能和社会行为”的研究成果后，再次于顶级学术期刊Nature（IF 49.962）上发表题为“Immune regulation by fungal strain diversity in inflammatory bowel disease”的文章，该研究通过对黏膜真菌多样性测序、培养组学、全基因组测序和免疫反应检测等实验，揭示了溃疡性结肠炎（UC）患者肠道黏膜中优势真菌-白色念珠菌（Ca）的菌株多样性及其对宿主肠道免疫调控的机制和菌株特异性，为研究IBD的疾病机理和治疗方法提供了新视角。 研究材料 结肠黏膜的灌洗液、C57BL/6J小鼠（SPF、GF）、Ca标准菌株和分离株 技术路线 · 步骤1：真菌多样性测序发现UC患者的结肠黏膜中Ca丰度明显增加； · 步骤2：真菌培养组学结合全基因组测序表明，人肠道Ca具有高菌株多样性，其对免疫细胞的破坏力以及在小鼠肠道中诱导Th17和促炎免疫的能力具有菌株特异性； · 步骤3：机制上，高免疫细胞破坏力（HD）的Ca菌株通过分泌念珠菌素（受Efg1-Ece1调控）促进肠道炎症，且该作用依赖于IL-1β，阻断其受体IL-1R可在小鼠中减轻疾病； · 步骤4：患者的Ca菌株诱导免疫细胞损伤和IL-1β表达的能力可反映患者疾病严重程度。 本研究开发了一个转化平台，用于在真菌菌株和患者特定水平上对真菌生物群进行功能分析。该平台结合了高分辨率真菌生物群测序、真菌培养组学和基因组学、基于CRISPR-Cas9的真菌菌株编辑系统、体外功能性免疫反应性测定和体内模型，能够检查人类肠道中的宿主-真菌间crosstalk。本文发现机会性Ca菌株具有丰富的遗传多样性，这些菌株在炎症性肠病患者的结肠粘膜中占主导地位。人肠道来源的Ca分离株中，具有高免疫细胞损伤能力的菌株反映了UC个体患者的疾病特征，并通过IL-1β依赖性机制在体内加重了肠道炎症。从良性共生到致病状态的转变过程中，HD菌株对利基特异性炎症免疫和产IL-17A的Th17细胞的抗真菌反应依赖于Ca分泌的念珠菌素。这些发现揭示了人类肠道中宿主-真菌相互作用的菌株特异性，并突出了炎症性疾病新的诊断和治疗靶点。 点击链接查看文章详情：https://mp.weixin.qq.com/s/AbFasM2KJL1XkILZkhGRgA |
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