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ganggang6667

银虫 (初入文坛)

[交流] 菌株的鉴定

自己分离出一株未知细菌,经过16SRNA比对找不到相似的菌,看了看伯杰氏细菌分离手册依然是一头雾水,谁有菌类鉴定的更好方法,一起分享~~

[ Last edited by amisking on 2009-9-5 at 20:57 ]
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greatwall8596


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
可能是你的测序结果不正确,或者比对方法不对
2楼2009-09-05 20:55:12
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rural2084

木虫 (正式写手)

楼主确认序列正确,比对正确?
3楼2009-09-05 23:48:27
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kitty8682

金虫 (正式写手)

可能是序列问题吧
4楼2009-09-06 08:34:22
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lishu2003528

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
建议楼主先用放线菌鉴定手册把与目的菌表型相似的种都列出来,再查询这些种的16s序列,与目的菌的序列作对照,相似性最高的那株菌差不多就是了。
5楼2009-09-06 10:04:22
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yuning907

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我最近也在做鉴定 也很迷茫 不知道有没有鉴定菌株的试剂盒卖啊 或者一些商品化的鉴定工具 有做过的请指教 谢谢
6楼2009-09-06 12:15:35
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ganggang6667

银虫 (初入文坛)

16S鉴定正确,所用引物1387r和63f,序列测通,碱基数目正确!
哪位有伯杰氏细菌鉴定具体的步骤~~
7楼2009-09-06 22:17:05
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硕人

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
可以用biolog做一下,16s测出的片段太小。或者用梅里埃的细菌鉴定
也无风雨也无晴
8楼2009-09-06 23:17:41
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天空3979

铁虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
伯杰氏手册参考作用不大,个人感觉,你不如试试东秀珠的<常见细菌系统鉴定手册>,如果你需要的话,发给你。
9楼2009-09-29 15:32:38
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