24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1478  |  回复: 12
当前主题已经存档。

antediluvian

金虫 (初入文坛)

[交流] 【转载】Lammps 更新 官方支持 GPU 计算

14 Aug 2009

Mike Brown (Sandia) has created a LAMMPS-specific NVIDIA GPU library and created two pair styles that work with it: pair_style lj/cut/gpu and pair_style gayberne/gpu. This means you can run those pairwise computations within LAMMPS in an accelerated fashion, on one or more NVIDIA GPU cards, assuming your system has them.

The speed-up you'll achieve depends on hardware (both CPU and GPU), the size of your system, the cutoff, and the relative expense of the pairwise computation itself. Mike has seen about a 4x speed-up for the Lennard-Jones potential, and about 100x for the GayBerne.

This section of the manual has background info on the use of GPUs with LAMMPS. We plan to add more GPU-enabled pair styles in the future.

大赞,赶快搞台机器试一下,合适的话将大大降低普通MD计算门槛,值得所有做材料模拟方面同学的关注。

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 13:48 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

recoli

金虫 (正式写手)

真牛,顶一下
2楼2009-09-05 20:01:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hooge

木虫 (正式写手)

能用中文解释一下吗
世界是分为你和他人两个方面的!
3楼2009-09-09 15:55:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

狼狼乾坤

铁杆木虫 (职业作家)

GPU??????
努力找方向!
4楼2009-09-09 21:37:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 狼狼乾坤 at 2009-9-9 21:37:
GPU??????

GPU就是显卡
GPU英文全称Graphic Processing Unit,中文翻译为“图形处理器”。GPU是相对于CPU的一个概念,由于在现代的计算机中(特别是家用系统,游戏的发烧友)图形的处理变得越来越重要,需要一个专门的图形的核心处理器。
5楼2009-09-10 12:56:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shalene

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-11 18:10
目前所有利用GPU加速的MD程序,都支持Nvidia的CUDA。极少数同时支持AMD的stream
6楼2009-09-10 13:42:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuyalihd

铜虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-11 18:10
如果利用GPU,那要花钱买GPU机器。普通机器不行的,跑不起来!
GPU不通用,很多intel/AMD 多核机器上跑得很好的程序都不能执行。它要特别写程序的!

不通用是缺陷,体积小价格低是优点。作权衡吧!
7楼2009-09-11 14:42:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

antediluvian

金虫 (初入文坛)

★ ★
yjcmwgk(金币+2,VIP+0): 9-14 12:58
引用回帖:
Originally posted by liuyalihd at 2009-9-11 14:42:
如果利用GPU,那要花钱买GPU机器。普通机器不行的,跑不起来!
GPU不通用,很多intel/AMD 多核机器上跑得很好的程序都不能执行。它要特别写程序的!

不通用是缺陷,体积小价格低是优点。作权衡吧!

你是说Tesla,实际上如果你真的想如此大规模并行的话Tesla是个好的选择,但实际上一般规模的应用只需要普通PC就可以,可以参考各个MD程序的测试机器很多都是普通机器,NAMDpaper里面就是用了8800GTX而已。普通PC加上一块民用级显示卡就可以使用这些程序。GPU的lib和Intel/AMD的肯定不同,但只要你使用的程序可以在上面运行就可以,例如Lammps, Gaussian这些,那就已经可以做很多事情了。至于那些需要通用CPU的程序同样可以在这些机器上运行,无非不调用GPU而已了。
8楼2009-09-14 12:24:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wally8962

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 9-14 13:55
是要特别写程序。而且不是件容易的事。
要不然干吗lammps/gpu出来让人高兴。
9楼2009-09-14 13:54:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
香港那个胡仲豪研究组已经在GPU上跑MD了 他们自己写的
我们组也正在买 估计很快可以跑起来了 不过改程序需要很大的精力
10楼2009-09-14 15:43:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 antediluvian 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 285求调剂 +15 哦呦呼o 2026-04-04 17/850 2026-04-06 23:02 by chenzhimin
[考研] 301求调剂 +14 121. 2026-04-04 14/700 2026-04-06 22:52 by qlm5820
[考研] 265求调剂 +9 小木虫085600 2026-04-06 9/450 2026-04-06 22:34 by chenzhimin
[考研] 调剂求助(生物与医药) +3 @6952 2026-04-06 3/150 2026-04-06 21:48 by Ecowxq666!
[考研] 338求调剂 +4 我想上岸ii 2026-04-05 4/200 2026-04-06 21:04 by 木子君1218
[考研] 270分求调剂 +5 maxjxbsk 2026-04-01 5/250 2026-04-06 15:32 by lin-da
[考研] 081700化学工程与技术 一志愿中海洋 323 求调剂学校 +18 披星河 2026-04-03 18/900 2026-04-06 13:55 by BruceLiu320
[考研] 生物与医药调剂 +4 十七sa 2026-04-05 4/200 2026-04-05 20:05 by lys0704
[考研] 调剂 +8 熊二想上岸 2026-04-04 8/400 2026-04-05 05:27 by houyaoxu
[考研] 22408求调剂 354分 可跨专业 +3 hannnnnnn 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:35 by 土木硕士招生
[考研] 0710生物学336分求调剂 +6 kiyy 2026-04-01 8/400 2026-04-04 10:10 by kiyy
[考研] 求调剂机会 +5 意染ivy 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:13 by qoooooo614
[考研] 0705理学294求调剂 +3 成果成果cg5 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:04 by simons1972
[考研] 326求调剂 +10 崽崽仔 2026-04-02 10/500 2026-04-03 09:08 by 帕尔马拉特
[考研] 材料专业求调剂 +10 月月鸟木 2026-04-01 10/500 2026-04-02 12:57 by wxiongid
[考研] 085600 一志愿9 总分351 求调剂学校 +7 czhcz 2026-03-31 9/450 2026-04-01 19:24 by 无际的草原
[考研] 生物与医药考研调剂 +5 铁憨憨123425 2026-03-31 5/250 2026-04-01 18:01 by syh9288
[考研] 材料专业调剂 +5 啦啦啦哭 2026-03-31 6/300 2026-04-01 16:48 by JourneyLucky
[考研] 求0861交通运输专硕or材料专硕调剂 +4 勒布朗@ 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:54 by 一只好果子?
[考研] 英一数一总分334求调剂 +4 陈阳坤 2026-03-31 4/200 2026-03-31 14:22 by 记事本2026
信息提示
请填处理意见