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小陈要毕业

新虫 (初入文坛)

[交流] 各位大佬能帮我看看我的胶图吗?是RNA发生了降解吗?我的5s特别亮 已有2人参与

第一次提细菌RNA,我用的2k的maker 我的5S条带特别亮,这是降解了吗?可以用来做定量吗?

各位大佬能帮我看看我的胶图吗?是RNA发生了降解吗?我的5s特别亮


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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲,勿施于人


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不像是降解了,倒是有些组像是有基因组DNA污染
The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
3楼2022-03-30 09:02:10
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atikou

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
细菌RNA提取后,下面很亮的条带就是降解的RNA,但是并不是说就是因为操作原因造成的,从图中可以看到还是有两条条带的,23S与16S都还在,所以并不是RNA在操作过程中意外引入了RNA酶,大概率的原因是因为大部分的细菌已经凋亡了。细菌的半衰期本身就短,所以提取后会有大量的降解的RNA,图中的情况正是因为降解的RNA太多,导致图中的23S,与16S的条带比较浅显。继续完成下游实验是没什么问题的。
-------------来自深圳市易基因的回复
2楼2022-03-29 17:26:58
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