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求评判?自己的序列A未找到模板,但相似高的序列B出发点找到了模板,用后者建模行吗?
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bigenid
木虫
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(小学生)
金币: 3079.7
帖子: 1573
在线: 510.2小时
虫号: 1506056
[交流]
求评判?自己的序列A未找到模板,但相似高的序列B出发点找到了模板,用后者建模行吗?
用自己的ABC蛋白酶序列(称为前者)建模,采用同源建模,通过比对,没有高于30%的模板,
但在NCBI上找到相同物种的ABC蛋白酶相似序列(称为后者;与我们自己的物种相同,基因组序列不完全相同,可能是重测序,且而菌株不一样),
利用“后者”进行下一步同源建模比对,结果能找到高于30%的模板,请问通过这种方法建模,算合格吗?
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