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咩咩喵

新虫 (初入文坛)

[交流] 单细胞测序数据里面的NA基因怎么处理? 已有1人参与

从GEO上下载了一个单细胞测序的数据,准备用R语言挖掘,但是读取之后发现有一些重复的基因名,还有一些<NA>基因,然后就不能把数据框的行名改成基因名,这样CreateSeuratObject的时候基因名全变成了序号,想知道有什么办法可以处理这个问题吗???
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yjz1990

新虫 (初入文坛)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
一般情况下不太会出现行名的基因是重复的情况,如果出现了NA, 需要把这些行进行过滤处理的。然后再使用Seurat读入就可以了。
承接各类生物信息学个性化分析项目
2楼2022-03-18 19:11:55
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