| 查看: 1073 | 回复: 1 | ||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者符先森将赠送您 5 个金币 | ||
[求助]
求助，Jmol如何扩胞 已有1人参与
|
||
|
求助，在windows系统中使用Jmol看过渡态反应路径的时候，关键部分原子在晶胞的边界，看的太难受了，有没有什么方法可以扩胞下，类似于ms的周期性扩胞。 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
不自信的我
已经有11人回复
-
北核录用
已经有3人回复
-
要不要辞职读博？
已经有6人回复
-
实验室接单子
已经有3人回复
-
磺酰氟产物，毕不了业了！
已经有8人回复
-
求助:我三月中下旬出站，青基依托单位怎么办？
已经有10人回复
-
26申博（荧光探针方向，有机合成）
已经有4人回复
-
论文终于录用啦！满足毕业条件了
已经有26人回复
-
2026年机械制造与材料应用国际会议 （ICMMMA 2026）
已经有4人回复
-
Cas 72-43-5需要30g，定制合成，能接单的留言
已经有8人回复
valenhou001
至尊木虫 (职业作家)
- 1ST强帖: 13
- 应助: 241 (大学生)
- 金币: 25701.7
- 散金: 602
- 红花: 166
- 帖子: 3782
- 在线: 873.8小时
- 虫号: 1007127
- 注册: 2010-04-27
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
【答案】应助回帖
|
写一个jmol的脚本文件，以.spt为后缀（或扩展名的），文件里写入如下的内容，特别是第一行，第一行里通过load命令导入要打开的文件名（可以加上它的路径），你可以修改{....}里的参数，进行扩胞。打开jmol后，直接将该文件拖到jmol的窗口里： load "n9_200879.vasp.cif" packed supercell {1 1 1} #rotate x -75 unitcell 0002 axes 0002 set ambient 40; set specpower 90 #select *; color bonds none; wireframe 0.05 #select tungsten; wireframe off spacefill ionic font axes 30 set minBondDistance 1.0 select *;color bonds none;wireframe 0.0;set bondmode AND select tungsten; wireframe 0.0 select carbon; spacefill 20% select tungsten; color [0,161,255] select boron; spacefill 13%; color atoms white; label "X";set labelalignment center; set labeloffset 0 0; color label red; font label 40 arial bold hide atomZ=[0.0 4.750] |
2楼2022-03-08 08:49:49