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雨后郁金香

金虫 (小有名气)

[交流] 请问:如何寻找一个新的基因

本人在做一个基因敲除的课题,关于这株菌的基因敲除做的很少,刚开始做有点茫然。。。想知道该如何去寻找这株菌的基因?比如去EST库里面怎么寻找?又怎样知道这个基因与该菌的某个代谢路径有关?
虫子里有没有做基因敲除的大侠们啊,能否给些你们的经验与心得呢?先谢过了。。。。。
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rural2084

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
不知道楼主要敲出的是什么基因。敲出基因,为何又要寻找新的基因呢?不是特别明白,希望楼主说具体一点。
3楼2009-09-01 10:08:26
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雨后郁金香

金虫 (小有名气)

补充下,偶想知道做基因敲除时如何选定一个基因?
2楼2009-09-01 10:07:07
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雨后郁金香

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by rural2084 at 2009-9-1 10:08:
不知道楼主要敲出的是什么基因。敲出基因,为何又要寻找新的基因呢?不是特别明白,希望楼主说具体一点。

恩,现在就是不懂得怎样确定一个基因,或者说还不甚清楚偶研究的这株菌的代谢途径中的相关基因。。。。
4楼2009-09-02 08:00:02
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yidaqunyan

木虫 (正式写手)

博士


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 雨后郁金香 at 2009-9-2 08:00:


恩,现在就是不懂得怎样确定一个基因,或者说还不甚清楚偶研究的这株菌的代谢途径中的相关基因。。。。

先看合成的是什么蛋白,根据其他微生物合成同一蛋白的已测序列设计引物,做PCR
或者看代谢途径中相关限速酶可能是什么酶,设计相关引物
或者代谢产物在其他种类,研究比较深入的几种菌数据库中搜索
不孝有三,读博为大!
5楼2009-09-02 11:12:09
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