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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化图形可视化软件 » 【其他】一个漂亮的分子
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

[交流] 【其他】一个漂亮的分子

GaussView4.12画分子结构，存成Mol格式
在MS4.3更改显示效果
ChemDraw12.0画示意图
Photoshop CS3整合

弄完了，小老板正好经过，笑话我“闲得蛋疼”

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 16:15 ]
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1楼 2009-08-29 11:19:15
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★
loovfnd(金币+1,VIP+0):挺好看的 8-29 19:59
又整了一个，小老板说“完全不实用，别扯犊子了，看文献去！”
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2楼2009-08-29 11:24:33
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psfan

铁虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+1,VIP+0):对 8-29 14:05
是用卟啉配合物研究自组装分子器件么？
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3楼2009-08-29 13:54:49
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ZJboy

木虫 (著名写手)
★
loovfnd(金币+1,VIP+0):谢谢参与！ 8-29 20:00
请问是否有对这些分子进行理论计算？如果有的话，用什么软件及方法？谢谢。
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4楼2009-08-29 16:59:35
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
★
yjcmwgk(金币+0,VIP+0):震惊！你怎么知道的？ 8-29 17:15
yjcmwgk(金币+0,VIP+0):大老板是北方人，二老板是北方人，三老板是北方人，四老板是北方人，五老板是北方人，六老板是北方人，刚刚成为讲师的七老板，嘿，还是北方人。 8-29 17:17
yjcmwgk(金币+0,VIP+0):跟我说“别扯犊子了”的，就是七老板 8-29 17:19
loovfnd(金币-1,VIP+0):私下交流！ 8-29 20:00
你老板北方人？
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5楼2009-08-29 17:03:35
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★
loovfnd(金币+1,VIP+0):谢谢学术交流! 8-29 20:00
引用回帖:
Originally posted by ZJboy at 2009-8-29 16:59:
请问是否有对这些分子进行理论计算？如果有的话，用什么软件及方法？谢谢。

全用Gaussian。先对单体进行DFT计算。然后冻结单体的结构，做QM/MM的oniom计算。有时候还会用PM3MM方法

我主要不做这种计算。我师弟做得多。我主要是小分子高精度计算

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-8-29 at 17:22 ]
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6楼2009-08-29 17:20:32
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
loovfnd(金币-1,VIP+0):象征性罚款，学术交流最好！ 8-29 20:01
yjcmwgk(金币+1,VIP+0):偷偷把分数还给你，嘘，别声张 11-15 16:59
因为“扯犊子”是典型的东北话，出了东三省，基本上没有人会讲这个，呵呵……
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7楼2009-08-29 19:51:14
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ZJboy

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2009-8-29 17:20:

全用Gaussian。先对单体进行DFT计算。然后冻结单体的结构，做QM/MM的oniom计算。有时候还会用PM3MM方法

我主要不做这种计算。我师弟做得多。我主要是小分子高精度计算

[ Last edited by yjcmwgk on 2009 ...

只用高斯的话，还是没办法优化这样的结构。但是这边只有高斯......
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8楼2009-08-29 20:20:19
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 8-30 20:04
引用回帖:
Originally posted by ZJboy at 2009-8-29 20:20:
只用高斯的话，还是没办法优化这样的结构。但是这边只有高斯......

我师弟用的服务器，拥有16G的共享内存和8个核心，而且是用nproclinda连接2台。我的计算资源仅仅相当于他的一半而已。这就是做大体系的人的优势——有足够的理由要求更多的计算资源

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-8-29 at 21:59 ]
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9楼2009-08-29 21:51:59
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neweroica

木虫 (著名写手)
yjcmwgk(金币+0,VIP+0):谢您吉言! 8-29 21:59
不算闲得蛋疼。等你们准备发Nature了，就会觉得其重要性了。
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Simpler, stronger, more tolerant
10楼2009-08-29 21:55:35
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