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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » ADF/Dalton » 【求助】linux下Gd-Fe配合物磁性计算输入文件错误
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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yyyttp

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】linux下Gd-Fe配合物磁性计算输入文件错误

每次都是在以下四句话是ADF程序退出。
       请问输入文件错在哪里？该怎样改？
                  Configuration of Valence Electrons
                 ( determined in the SCF procedure )
                   Total:   134 (Spin-A)  + 122 (Spin-B)
                    Net Charge: 0 (Nuclei minus Electrons)

输入文件为：
#! /bin/sh

ADF=$ADFBIN/adf
DIRAC=$ADFBIN/dirac

$DIRAC<$ADFRESOURCES/Dirac/Gd.4d
rm -f  F*

$DIRAC<$ADFRESOURCES/Dirac/Fe.3p
rm -f  F*

$DIRAC<$ADFRESOURCES/Dirac/C.1s
rm -f  F*

$DIRAC<$ADFRESOURCES/Dirac/N.1s
rm -f  F*

$DIRAC<$ADFRESOURCES/Dirac/O.1s
rm -f  F*

$DIRAC<$ADFRESOURCES/Dirac/H
rm -f  F*

mv TAPE12 t12.Gd-Fe
rm -f  T*

$ADF< create Gd $ADFRESOURCES/TZP/Gd.4d
occupation
s 4 2
p 6
d 1
f 7
end
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  Gd 1
end      
endinput
EOF
mv TAPE21 ft21.Gd
rm -f  T*


$ADF< create Fe $ADFRESOURCES/TZP/Fe.3p
occupation
s 2
d 6
end
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  Fe 2
end      
endinput
EOF
mv TAPE21 ft21.Fe
rm -f  T*

$ADF< create C $ADFRESOURCES/TZP/C.1s
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  C 3
end
endinput
EOF
mv TAPE21 ft21.C
rm -f  T*

$ADF< create N $ADFRESOURCES/TZP/N.1s
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  N 4
end
endinput
EOF
mv TAPE21 ft21.N
rm -f  T*


$ADF< create O $ADFRESOURCES/TZP/O.1s
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  O 5
end
endinput
EOF
mv TAPE21 ft21.O
rm -f  T*   


$ADF< create H $ADFRESOURCES/TZP/H
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  H 6
end
endinput
EOF
mv TAPE21 ft21.H
rm -f  T*
            

$ADF< title caculation of Gd-Fe

atoms
Gd  -0.0623  -0.2302  -0.2503  f=Gd/1
Fe  0.2857  0.1386  -0.2492  f=Fe/2
O  0.0125  -0.2005  -0.0944
O  -0.1543  -0.3841  -0.1678
O  0.1775  -0.3043  -0.2437
O  0.0341  -0.1932  -0.4009
O  -0.2660  -0.1789  -0.3426
O  -0.0966  -0.3851  -0.3504
O  -0.2589  -0.1511  -0.1578
N  0.0492  -0.0449  -0.2503
N  0.5120  -0.0457  -0.2558
N  0.2719  0.1697  -0.4618
N  0.5363  0.3120  -0.2510
N  0.0460  0.3120  -0.2393
N  0.2743  0.1332  -0.0347
N  0.2600  -0.1642  -0.0826
N  -0.2032  -0.3754  -0.0121
N  0.2390  -0.4331  -0.3492
N  0.0820  -0.1279  -0.5460
C  0.1339  0.0257  -0.2504
C  0.4299  0.0243  -0.2543
C  0.2814  0.1539  -0.3836
C  0.4424  0.2476  -0.2489
C  0.1368  0.2488  -0.2422
C  0.2814  0.1337  -0.1147
C  0.1203  -0.1741  -0.0484
C  0.1160  -0.1489  0.0501
C  0.2795  -0.1412  0.0745
C  0.3664  -0.1371  -0.0150
C  -0.1935  -0.4248  -0.0918
C  -0.2327  -0.5412  -0.0777
C  -0.2728  -0.5505  0.0252
C  -0.2570  -0.4424  0.0661
C  0.2674  -0.3595  -0.2869
C  0.4306  -0.3540  -0.2767
C  0.4921  -0.4197  -0.3563
C  0.3669  -0.4859  -0.3920
C  0.1209  -0.1617  -0.4651
C  0.2828  -0.1568  -0.4625
C  0.3350  -0.1072  -0.5543
C  0.2008  -0.1030  -0.6129
H  0.2764  -0.1923  -0.1433
H  -0.1924  -0.3143  -0.0073
H  0.1644  -0.4583  -0.3593
H  0.0014  -0.1263  -0.5562
H  -0.3414  -0.1443  -0.3283
H  -0.2644  -0.1793  -0.3923
H  -0.1304  -0.4503  -0.3323
H  -0.0994  -0.3833  -0.3863
H  -0.2564  -0.1363  -0.1023
H  -0.3225  -0.1173  -0.1743
H  0.2524  -0.3843  -0.6873
H  0.1294  -0.3723  -0.7173
H  -0.1184  -0.4193  -0.4763
H  -0.1015  -0.3604  -0.5533
H  0.0657  -0.2052  0.0851
H  0.0688  -0.0825  0.0620
H  0.3048  -0.2034  0.1093
H  0.2978  -0.0781  0.1097
H  0.4072  -0.0664  -0.0254
H  0.4426  -0.1879  -0.0151
H  -0.1525  -0.5850  -0.0942
H  -0.3153  -0.5611  -0.1137
H  -0.2082  -0.5988  0.0539
H  -0.3715  -0.5766  0.0343
H  -0.3493  -0.4178  0.0901
H  -0.1884  -0.4421  0.1142
H  0.4561  -0.3840  -0.2186
H  0.4665  -0.2814  -0.2812
H  0.5661  -0.4661  -0.3341
H  0.5335  -0.3738  -0.4032
H  0.3659  -0.4826  -0.4578
H  0.3710  -0.5593  -0.3724
H  0.3204  -0.2276  -0.4561
O  -0.0633  -0.3905  -0.5422
H  0.3133  -0.1133  -0.4122
H  0.4078  -0.1506  -0.5837
O  0.1910  -0.4043  -0.6727
H  0.3741  -0.0364  -0.5451
H  0.1909  -0.0333  -0.6392
H  0.2052  -0.1555  -0.6611
end
   

fragments
Gd ft21.Gd
Fe ft21.Fe
C  ft21.C
N  ft21.N
O  ft21.O
H  ft21.H
end

Fragoccupations
  Gd
  s 1//1
  s 1//1
  p 3//3
  d 1//0
  f 7//0
end

Fragoccupations
  Fe
  s 1//1
  d 5//1
end

Modifystartpotential
Gd/1 13//5
Fe/2 6//2
End   

xc
gga Becke Perdew
end

Symmetry NOSYM
INTEGRATION 6.0
unrestricted
charge 0 12
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  Gd 1
  Fe 2
  C 3
  N 4
  O 5
  H 6
end      

Eprint
scf eigval
eigval 86 20
orbpop 86     
subend
End

scf
iterations 300
Conv 1e-6
mixing 0.05
end

end input   
eor

mv TAPE21 test-Gd-Fe.t21

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 20:07 ]
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1楼 2009-08-28 11:46:54
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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yyyttp(金币+8,VIP+0):100 9-16 09:42
可能是在以下的
$ADF< create Gd $ADFRESOURCES/TZP/Gd.4d
occupation
s 4 2
p 6
d 1
f 7
end
       occupation设置错误，可以尝试不设置，只设置Modifystartpotential，即Gd\Fe的自旋极化起始势，试试能不能正常收敛。
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2楼2009-09-16 09:39:48
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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
yjr(金币+2,VIP+0):谢谢！！ 9-16 10:23
yyyttp(金币+4,VIP+0):100 9-16 10:56
eigval 86 20中的总阿尔法电子数设置错误，应该为134.

可以将输入文件改为以下形式试一试：
#! /bin/sh

ADF=$ADFBIN/adf
DIRAC=$ADFBIN/dirac

$DIRAC<$ADFRESOURCES/Dirac/Gd.4d
rm -f  F*

$DIRAC<$ADFRESOURCES/Dirac/Fe.3p
rm -f  F*

$DIRAC<$ADFRESOURCES/Dirac/C.1s
rm -f  F*

$DIRAC<$ADFRESOURCES/Dirac/N.1s
rm -f  F*

$DIRAC<$ADFRESOURCES/Dirac/O.1s
rm -f  F*

$DIRAC<$ADFRESOURCES/Dirac/H
rm -f  F*

mv TAPE12 t12.Gd-Fe
rm -f  T*

$ADF< create Gd $ADFRESOURCES/TZP/Gd.4d
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  Gd 1
end      
endinput
EOF
mv TAPE21 ft21.Gd
rm -f  T*

$ADF< create Fe $ADFRESOURCES/TZP/Fe.3p
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  Fe 2
end      
endinput
EOF
mv TAPE21 ft21.Fe
rm -f  T*

$ADF< create C $ADFRESOURCES/TZP/C.1s
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  C 3
end
endinput
EOF
mv TAPE21 ft21.C
rm -f  T*

$ADF< create N $ADFRESOURCES/TZP/N.1s
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  N 4
end
endinput
EOF
mv TAPE21 ft21.N
rm -f  T*

$ADF< create O $ADFRESOURCES/TZP/O.1s
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  O 5
end
endinput
EOF
mv TAPE21 ft21.O
rm -f  T*   

$ADF< create H $ADFRESOURCES/TZP/H
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  H 6
end
endinput
EOF
mv TAPE21 ft21.H
rm -f  T*
            
$ADF< title caculation of Gd-Fe

atoms
Gd  -0.0623  -0.2302  -0.2503  f=Gd/1
Fe  0.2857  0.1386  -0.2492  f=Fe/2
O  0.0125  -0.2005  -0.0944
O  -0.1543  -0.3841  -0.1678
O  0.1775  -0.3043  -0.2437
O  0.0341  -0.1932  -0.4009
O  -0.2660  -0.1789  -0.3426
O  -0.0966  -0.3851  -0.3504
O  -0.2589  -0.1511  -0.1578
N  0.0492  -0.0449  -0.2503
N  0.5120  -0.0457  -0.2558
N  0.2719  0.1697  -0.4618
N  0.5363  0.3120  -0.2510
N  0.0460  0.3120  -0.2393
N  0.2743  0.1332  -0.0347
N  0.2600  -0.1642  -0.0826
N  -0.2032  -0.3754  -0.0121
N  0.2390  -0.4331  -0.3492
N  0.0820  -0.1279  -0.5460
C  0.1339  0.0257  -0.2504
C  0.4299  0.0243  -0.2543
C  0.2814  0.1539  -0.3836
C  0.4424  0.2476  -0.2489
C  0.1368  0.2488  -0.2422
C  0.2814  0.1337  -0.1147
C  0.1203  -0.1741  -0.0484
C  0.1160  -0.1489  0.0501
C  0.2795  -0.1412  0.0745
C  0.3664  -0.1371  -0.0150
C  -0.1935  -0.4248  -0.0918
C  -0.2327  -0.5412  -0.0777
C  -0.2728  -0.5505  0.0252
C  -0.2570  -0.4424  0.0661
C  0.2674  -0.3595  -0.2869
C  0.4306  -0.3540  -0.2767
C  0.4921  -0.4197  -0.3563
C  0.3669  -0.4859  -0.3920
C  0.1209  -0.1617  -0.4651
C  0.2828  -0.1568  -0.4625
C  0.3350  -0.1072  -0.5543
C  0.2008  -0.1030  -0.6129
H  0.2764  -0.1923  -0.1433
H  -0.1924  -0.3143  -0.0073
H  0.1644  -0.4583  -0.3593
H  0.0014  -0.1263  -0.5562
H  -0.3414  -0.1443  -0.3283
H  -0.2644  -0.1793  -0.3923
H  -0.1304  -0.4503  -0.3323
H  -0.0994  -0.3833  -0.3863
H  -0.2564  -0.1363  -0.1023
H  -0.3225  -0.1173  -0.1743
H  0.2524  -0.3843  -0.6873
H  0.1294  -0.3723  -0.7173
H  -0.1184  -0.4193  -0.4763
H  -0.1015  -0.3604  -0.5533
H  0.0657  -0.2052  0.0851
H  0.0688  -0.0825  0.0620
H  0.3048  -0.2034  0.1093
H  0.2978  -0.0781  0.1097
H  0.4072  -0.0664  -0.0254
H  0.4426  -0.1879  -0.0151
H  -0.1525  -0.5850  -0.0942
H  -0.3153  -0.5611  -0.1137
H  -0.2082  -0.5988  0.0539
H  -0.3715  -0.5766  0.0343
H  -0.3493  -0.4178  0.0901
H  -0.1884  -0.4421  0.1142
H  0.4561  -0.3840  -0.2186
H  0.4665  -0.2814  -0.2812
H  0.5661  -0.4661  -0.3341
H  0.5335  -0.3738  -0.4032
H  0.3659  -0.4826  -0.4578
H  0.3710  -0.5593  -0.3724
H  0.3204  -0.2276  -0.4561
O  -0.0633  -0.3905  -0.5422
H  0.3133  -0.1133  -0.4122
H  0.4078  -0.1506  -0.5837
O  0.1910  -0.4043  -0.6727
H  0.3741  -0.0364  -0.5451
H  0.1909  -0.0333  -0.6392
H  0.2052  -0.1555  -0.6611
end

fragments
Gd ft21.Gd
Fe ft21.Fe
C  ft21.C
N  ft21.N
O  ft21.O
H  ft21.H
end

Modifystartpotential
Gd/1 13//5
Fe/2 6//2
End   

xc
gga Becke Perdew
end

Symmetry NOSYM
INTEGRATION 6.0
unrestricted
charge 0 12
RELATIVISTIC scalar ZORA
corepotentials t12.Gd-Fe &
  Gd 1
  Fe 2
  C 3
  N 4
  O 5
  H 6
end      

Eprint
scf eigval
eigval 134 20
orbpop 134     
subend
End

scf
iterations 300
Conv 1e-6
mixing 0.05
end

end input   
eor

mv TAPE21 test-Gd-Fe.t21
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3楼2009-09-16 09:49:40
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