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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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lyl941

新虫 (初入文坛)

[求助] MS中mesocite模块DPD模拟的参数问题已有1人参与

想请教各位大佬!!我是使用MS的mesocite模块进行高分子聚合物的DPD模拟,只用了一条链,目前模拟计算的速度非常快,模拟完毕后粗粒化模型从盒子内扩张出来特别大范围。我没有经过系统的学习,全是自己摸索着来的,不知道能否在盒子内设置多条粗粒化模型以及在模拟的过程中有没有参数设置错误的地方?
另外求MS或者别的软件DPD模拟的教程,有偿。

MS中mesocite模块DPD模拟的参数问题
模拟前粗粒化模型


MS中mesocite模块DPD模拟的参数问题-1
DPD模拟后粗粒化模型


MS中mesocite模块DPD模拟的参数问题-2
DPD参数设置


MS中mesocite模块DPD模拟的参数问题-3
DPD参数设置
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pzq1102

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

①用AC模块,可以设置多链条问题。
②NVT时间太短了,起码5ns
③教程的话,我也是自学的。我没有==,欢迎多多探讨一下。这篇还可以
pH-sensitive drug loading/releasing in amphiphilic copolymer PAE–PEG: Integrating molecular dynamics and dissipative particle dynamics simulations
2楼2022-05-23 16:13:26
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