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我是小梅

新虫 (初入文坛)

[交流] blast

请问大侠们怎样在NCBI上进行家蚕基因组序列比对啊!非常感谢!!!
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qqsvery

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这个是具体的网址:http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome

1.在“Enter Query Sequence”里输入你的序列,或上传你的FAST格式文件;

2.在里面的Choose Search Set项目里选择“Others (nr etc.): ”你看到“Organism
Optional ”在里面输入“bombyx mori”即家蚕的英文,

3.然后点“BLAST”,就可以了!后期遇到什么问题在问我吧!
谎言和真实在河边洗澡,谎言先洗好,穿走了真实的衣服,真实却不肯穿谎言的衣服。后来人们眼里只有穿着真实衣服的谎言,却很难接受赤裸裸的真实。
3楼2009-12-08 10:35:24
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qqsvery

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
你进入NCBI的BLAST模式中,选择一种你要比对的生物,比如说Human ,Apis mellifera ,进入一个可以输入你的序列的界面,你可以输入FAST格式的核苷酸序列,点Begin Search,得到一个界面,里面点View report,就得到了你要比对的序列列表!
谎言和真实在河边洗澡,谎言先洗好,穿走了真实的衣服,真实却不肯穿谎言的衣服。后来人们眼里只有穿着真实衣服的谎言,却很难接受赤裸裸的真实。
2楼2009-12-08 10:01:39
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