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新虫 (初入文坛)

[交流] 组学研究如何做好质量控制?——摩赛恩

组学研究一般具有样本数量大,样本收集周期长,个体差异大,样本处理流程长、过程复杂,耗材种类多,检测设备不稳定性等特点。所以,质量控制是组学研究的重要基础。
       1、样本收集方案:研究方案中应明确样本分组,每组样本数量,样本供体的纳排标准,每个样本的采集方法、体积/重量,现场前处理要求,储存条件,样本信息收集标准等内容,避免产生错误采集、混肴、交叉错配等问题。
       2、耗材、储存、运输条件准备:离心管/离心机、现场前处理试剂、移液枪、封口膜、样本标签、干冰、保温厚泡沫箱、-20℃/-80℃冰箱等均应按标准准备到位,最好是知名品牌,并经过预试验验证,确保不会引入污染物;寻找有资质的冷链运输服务供应商提供样本运输服务,确保样本不变质。
       3、样本采集人员要求:需经过系统培训,熟悉样本采集、现场前处理流程,操作规范、熟练,持证上岗。
       4、样本分组原则:通过筛查关键理化指标、疾病诊断分类/分级,尽可能选择指标相近的样本归入同一组;若同时收集同一样本供体的2种以上样本(如血液、尿液),这2种样本最好配对归入同一样本集,如发现集;从而尽可能降低同组、同集样本间的个体差异。
       5、样本处理人员要求:需经过系统培训,熟悉样本前处理流程,操作规范、熟练,持证上岗。
       6、样本质量控制:确保样本按规程一次解冻、快速取样,避免反复冻融;通过外观、理化指标、光谱检测、SDS-PAGE凝胶分析等,剔除溶血、降解等不合格样本;同组样本随机筛选其中的20%,等量收集后混合,处理方法与实际样品一致,制备质控样品(QC)。
       7、样本处理:不同类型的样本,如血液/尿液/组织等,需根据目标分子的性质、含量、干扰杂质等情况,设计、摸索、优化最佳前处理方法,以最大限度除去杂质、保留目标分子,或改变目标分子性质,适应检测方法,或提升目标分子的检测灵敏度;鉴于实验过程复杂、步骤多,需高效、熟练、有序地按流程处理样品,如移液时需避免上/下相交叉污染、避免气泡,避免引入偶然误差或污染物。
       8、色谱质谱联用仪的选择、调试、校准:根据研究目的选择合适的色谱质谱联用仪;严格按照色谱质谱联用仪的操作规程(SOP)进行设备参数的设置、调试和校准,确保设备运行准确、稳定。
       9、样品检测方法的建立与优化:参考已有文献和试验积累,建立样品分析检测方法,包括色谱类型、流动性选择,色谱梯度、流速、质谱检测参数设置等,并根据目标分子的检测灵敏度、准确性、重现性、与杂质的分离度等加以优化和验证,确定最佳样品分析检测方法。
       10、数据采集:均匀插入空白对照、标准品对照、QC样品,一般每6-8次插入一个空白对照、标准品对照和/或QC样品,以避免残留影响、帮助色谱峰校准;将不同批次收集的样本与对照样本根据分析序列交替进行数据采集,以避免批次效应;每个样品中加入内标,以帮助色谱峰校准和仪器稳定性监测;每个样本重复检测三次,取均值以避免偶然误差。
        11、数据质量评估:采用误差分析、聚类分析、主成分(PCA)分析、变异系数(CV)分析等方法,评估数据采集的质量,若数据不合格,需重新采集、评估。
   
        在组学研究过程中,如果严格按照上述方法进行过程质量控制,则基本可以获得较高质量的组学检测数据,为后续数据处理、差异分析、特征分子鉴定、分类模型构建和优化奠定良好的基础。
   
        摩赛恩科技聚焦分子智能识别检测技术,开发自主知识产权核心算法,提供专业化组学和质谱数据处理、挖掘服务,满足生物医药、食品等行业质谱用户个性化分子智能识别需求。在组学研究过程中,努力优化组学研究过程中的质量控制方法,才能为客户呈现最好的组学研究结果!
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