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Dusk_star

新虫 (初入文坛)

[求助] [求助]定点突变pcr产物,转化后提不出质粒

最近在做定点突变,设计上下游引物30bp左右,突变位点在中间,目的基因3300bp,加质粒总长9000bp左右。

PCR之后用DpnⅠ消除模板,转化JM109或BL21,然后挑菌送测序。最近总出现挑到的菌提质粒浓度很低是(三四十左右),送不了测序的那种,偶尔提出质粒浓度正常的还是模板情况。

而且我发现这种提不出质粒的情况不管IM109还是BL21都会出现,在提质粒过程中,加完P3 buffer混匀后,虽然有絮状沉淀但是液体浑浊(正常加完P3后,出现絮状沉淀,液体澄清透亮)。

之前也做了一批突变,还算正常。最近做的时候就总出现,想不到哪里出了问题。
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tmoonday

金虫 (小有名气)

你转DH5a试试?另外,冬天P2溶液沉淀多,你放37度热一下。
等一份缘分
2楼2021-12-09 22:40:23
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小汰宝

金虫 (正式写手)

1. 像楼上所说,用DH5α试试。JM109不了解,但是做突变转BL21的话效率很低
2. 环P质粒9000bp成功率也比较低。这么长质粒上的定点突变我一般只p个小几百bp的片段做突变,同时p剩下的载体部分最后做同源重组。麻烦是麻烦一些,但是成功率非常高
3. 你对9000bp质粒环p后看过胶图吗?目标条带应该不浓吧?你非要大质粒环p的话可以加甘油/dmso试下

发自小木虫IOS客户端
3楼2022-03-03 19:24:22
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L_大松子

新虫 (正式写手)

直接送菌液测序呗,价格差不多还省事

发自小木虫Android客户端
4楼2022-08-12 00:33:47
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