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liyuy0921

木虫 (正式写手)

[求助] 不做PCR试验,从全基因组数据上挖掘序列构建系统进化树的方法?

传统方法常使用叶绿体上的 trnH-psbA、trnL-F、trnT-L、matK和ndhF等基因片段构建系统进化树。而现在已经有越来越多的植物叶绿体全基因组都公布了,那问题来了:
问题1:可以利用文献中的引物,在现有的叶绿体全基因组上筛出trnH-psbA、trnL-F、trnT-L、matK和ndhF片段然后构建系统进化树吗?不做传统的PCR。
问题2:除了Blast外,有没有相关的软件可以快速的实现在基因组数据上用引物快速筛查某个片段?
问题3:作为科研工作人员,你觉得这种方法可靠吗?
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2楼2021-11-25 13:20:12
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