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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 两个分子间作用能曲线
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四点一线

银虫 (小有名气)

[求助] 两个分子间作用能曲线

我想计算两个分子之间的势能函数，将两个分子从原来的晶胞里面提取出来，为了避免晶胞带来的周期性影响，重新建了一个比较大的晶胞，将两个分子复制进去，然后移动其中一个分子，计算移动过程中两个分子之间的能量变化曲线，但是能量曲线的最低点，两个分子的平衡位置，与晶胞中两个分子的位置存在很大的差异，请问这是正常现象吗？如果是不正常的现象，该如何避免这一问题？
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1楼 2021-11-24 22:01:35
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aa小小佑

银虫 (职业作家)
你往不同方向拉远，结果都不一样。这种方式计算分子间势能是否正确啊？

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2楼2021-11-24 22:03:19
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四点一线

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by aa小小佑 at 2021-11-24 22:03:19
你往不同方向拉远，结果都不一样。这种方式计算分子间势能是否正确啊？

主要是沿着两个分子的质心方向拉，计算文献中给出的材料时得到的势能曲线基本是一致的，但是换了另外一种材料计算时就出现了势能曲线的最低点位置与两个分子存在晶胞中时的位置不一致这个问题
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3楼2021-11-25 09:39:24
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