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hjsjs

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】紧急求助关于过渡态能量的问题

我在研究离子与中性大分子反应体系,先是用am1方法优化好反应物即离子中性分子混合物,优化好生成的中间体产物,然后先是用qst2方法找到一个粗略的过渡态,这时候过渡态的能量大概为0.6 a.u,明显高于反应物和生成物,但是当我用qst3方法和TS方法用HF-32-1g进行精确优化过渡态的时候,都顺利完成,IRC检测合理,但是这两种方法下的过渡态能量居然是-800a.u.左右,不知道什么地方出现重大错误,请高手指点

另外电荷和自旋多重度都没有问题

另外是否是我的概念发生错误,本身方法并没有错误,我用gaussview打开out文件的时候,粗略过渡态的total energy 是0.6 a.u, 而精确过渡态的total energy 是-890 a.u? total energy 和total energy 之间有什么关系?

[ Last edited by hjsjs on 2009-8-24 at 20:47 ]
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

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★ ★ ★ ★ ★ ★
hjsjs(金币+3,VIP+0): 8-24 19:27
loovfnd(金币+3,VIP+0):谢谢参与! 8-24 21:27
HF严重忽略电子相关。结论很可能不合理,尤其是做过渡态的时候。
如果可能的话,试试DFT!
或者你可以用oniom来做QM/MM
2楼2009-08-24 19:26:31
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hjsjs

铜虫 (正式写手)

请教楼上,我用HF优化am1.QST2得到的粗略过渡态的新过渡态结构,与粗略过渡态结构差异并不大,难道HF不准确,会悬殊这么大?
3楼2009-08-24 19:29:14
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

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★ ★
hjsjs(金币+1,VIP+0): 8-24 20:44
loovfnd(金币+1,VIP+0):谢谢参与! 8-24 21:27
引用回帖:
Originally posted by hjsjs at 2009-8-24 19:29:
请教楼上,我用HF优化am1.QST2得到的粗略过渡态的新过渡态结构,与粗略过渡态结构差异并不大,难道HF不准确,会悬殊这么大?

HF在计算非共轭体系的稳定结构的时候,还是可以的。
但是HF在能量和性质计算上,有时候会与实际情况差距很大
4楼2009-08-24 20:42:36
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recoli

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
hjsjs(金币+5,VIP+0): 8-24 21:04
loovfnd(金币+5,VIP+0):谢谢参与! 8-24 21:26
楼主。你的0.6来自于AM1算法,-800来自于HF算法,根本没有可比性啊。根据你的描述我觉得你的过渡态没啥问题。如果你要比较粗略过渡态和精确过渡态的能量,可以都用AM1算一遍或者都用HF算一遍,再比较。
5楼2009-08-24 21:00:32
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

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★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
csfn(金币+2,VIP+0):thx 8-27 17:56
引用回帖:
Originally posted by recoli at 2009-8-24 21:00:
楼主。你的0.6来自于AM1算法,-800来自于HF算法,根本没有可比性啊。根据你的描述我觉得你的过渡态没啥问题。如果你要比较粗略过渡态和精确过渡态的能量,可以都用AM1算一遍或者都用HF算一遍,再比较。

可我总觉得HF算过渡态很不靠谱啊,不论是共轭体系还是非共轭体系
6楼2009-08-24 21:44:49
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liqx

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
csfn(金币+2,VIP+0):thx 8-27 17:56
有意义的是相对能量,你可以计算一下活化能,然后做一下比较。
7楼2009-08-27 17:41:03
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