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kjl8401金虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】vasp安装
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以前都是用师兄们已经编译好的，小虫现在安装VASP确出现了问题，主要有两个： 一个是我在原来电脑上编译的程序下安装了新的MKL，致使原来的VASP不能用了，主要感觉是原来的那台本身没有并行安装好，想自己试试，出现的问题是 tmpi_map.o fft3dlib.o -L../vasp.4.lib -ldmy ../vasp.4.lib/linpack_double.o -lmkl_lapack -lsvml /lib/libgoto_p4_512-r0.94.so /opt/intel/mkl/10.0.5.025/lib/64/libmkl_lapack.so: file not recognized: File format not recognized make: *** [vasp] 错误 1 [pub@localhost vasp.4.6]$ file /opt/intel/mkl/10.0.5.025/lib/64/libmkl_lapack.so /opt/intel/mkl/10.0.5.025/lib/64/libmkl_lapack.so: ELF 64-bit LSB shared object, IA-64, version 1 (SYSV), not stripped [pub@localhost vasp.4.6]$ 机子原本安装的是MKL9.0的，后来我换成10.0版，我把这个64的库变成em64t的，环境变量也设置了，但是还是出现这个，后来改成64的也不行，把他变成静态库连接也不行，后来就重新安装了9.0的，把环境变量重新换成了原来9.0的，还是不行，总是出现这个问题，不知道是什么原因。 第二个是吸取前面的教训，是在自己的一个目录下安装并行VASP，已经在自己的目录下安装了MPICH2,在大话西游上发现类似的帖子，无奈没领会，还是出现了一些问题，不知如何解决，请赐教！如： IPO link: can not find -ldmy ifort:error:problem during multi-file optimization compilation (code1) make *** [VASP] :错误 1 |
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yjr(金币+1,VIP+0):谢谢！！ 8-24 14:13
kjl8401(金币+2,VIP+0): 8-26 07:40
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8楼2009-08-24 11:17:55
2楼2009-08-23 11:38:24
★ ★ ★
wuli8(金币+1,VIP+0):3ks 8-24 07:10
kjl8401(金币+2,VIP+0):谢谢回复 8-24 08:32
wuli8(金币+1,VIP+0):3ks 8-24 07:10
kjl8401(金币+2,VIP+0):谢谢回复 8-24 08:32
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3楼2009-08-23 17:12:23
kjl8401
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1066.5
- 散金: 9
- 帖子: 394
- 在线: 25.3小时
- 虫号: 607471
- 注册: 2008-09-19
- 性别: GG
- 专业: 计算机软件
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我第一个问题的Makefile文件是 CPP_ = ./preprocess <$*.F | /usr/bin/cpp -P -C -traditional >$*$(SUFFIX) FFLAGS = -FR -lowercase -assume byterecl OFLAG=-O3 -xW -tpp7 OFLAG_HIGH = $(OFLAG) OBJ_HIGH = OBJ_NOOPT = DEBUG = -FR -O0 INLINE = $(OFLAG) # mkl.5.2 requires also to -lguide library # set -DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV in the CPP lines BLAS=-L/home/pub/intel/mkl/9.0/lib/em64t -lmkl -lguide -lpthread -lsvml #BLAS= /lib/libgoto_p4_512-r0.94.so #我试图注释和不注释这行都没作用 LAPACK= -lmkl_lapack LIB = -L../vasp.4.lib -ldmy \ ../vasp.4.lib/linpack_double.o $(LAPACK) \ $(BLAS) FC=mpif90 FCL=$(FC) CPP = $(CPP_) -DMPI -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \ -Dkind8 -DNGZhalf -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc \ -DMPI_BLOCK=500 \ -DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV SCA= FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fft3dlib.o 这是其中的Makefile文件 环境变量是 # .bashrc # Source global definitions if [ -f /etc/bashrc ]; then . /etc/bashrc fi source /home/pub/intel/fc/9.1.052/bin/ifortvars.sh # User specific aliases and functions export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel/mkl/9.0/lib/em64t export PATH=/home/pub/intel/mpich2/bin:$PATH export PATH=/home/pub/fftw/bin:$PATH export PATH=/bin:$PATH export PATH=/home/pub/intel/usr/lib:$PATH export PATH=/home/pub/intel/idb/9.1.052/bin:$PATH 另一个环境变量文件是 # .bash_profile # Get the aliases and functions if [ -f ~/.bashrc ]; then . ~/.bashrc fi source /opt/intel/mkl/9.0/tools/environment/mklvarsem64t.sh # User specific environment and startup programs export PATH=$PATH:/home/pub/intel/mpich2/lib export PATH=$PATH:/home/pub/fftw/lib export MPI_USEP4SSPORT=yes export MPI_P4SSPORT=22 export P4_RSHCOMMAND=ssh PATH=$PATH:$HOME/bin |
4楼2009-08-24 08:48:58