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【求助】关于冻结部分原子坐标
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| 要计算的分子含有平面共轭结构,但如果放开自由度结构优化的结果是共轭平面发生较大扭曲,这就和晶体结构(和计算分子骨架很相似但不完全一样)有较大出入。我的想法是采用先冻结二面角的方式保持共轭面然后再优化,但是这样的处理所有相关文献都没有提及,想问一下:1. 为了和晶体结构数据保持一致近似这么处理是否合理?2. 如果冻结后的总能量高于冻结前,是不是说冻结前的结构也就是共轭面扭曲的结构更稳定?3. 冻结坐标的处理在写文章的时候可以省略么? |
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