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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 用vasp进行纳米带吸附分子的优化时，吸附分子发生较大形变
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jkszd

新虫 (初入文坛)
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用vasp进行纳米带吸附分子的优化时，吸附分子发生较大形变
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描述:我在对纳米带进行吸附分子的相关计算时，发现在优化阶段，所吸附的分子发生较大形变。
在图1里我将吸附分子水平放在纳米带表面，但优化得到图2发现原来的分子发生较大形变，原来的平面环发生高低起伏，环外连接的原子也发生改变。
之前进行优化时吸附在纳米带上的分子未发生明显形变（原来是二维分子，优化后还是二维分子），如图3图4就是另外一个纳米带吸附分子体系优化前后的结构图，吸附分子仅在纳米带表面发生倾斜。
问题:这种形变是否是正常的？如果不正常，如何在优化过程中仅让吸附分子在纳米带表面发生移动，而不发生形变？求大佬解答

用vasp进行纳米带吸附分子的优化时，吸附分子发生较大形变


用vasp进行纳米带吸附分子的优化时，吸附分子发生较大形变-1


用vasp进行纳米带吸附分子的优化时，吸附分子发生较大形变-2


用vasp进行纳米带吸附分子的优化时，吸附分子发生较大形变-3


用vasp进行纳米带吸附分子的优化时，吸附分子发生较大形变-4


用vasp进行纳米带吸附分子的优化时，吸附分子发生较大形变-5


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1楼 2021-10-05 22:07:16
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jkszd

新虫 (初入文坛)
放错图了，图1，2和图3，4重复了，图5，6才是文字描述中的图3，4

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3楼2021-10-05 22:08:36
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chaofanc

新虫 (小有名气)
★
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我觉得是正常的，我做过类似的，也会发生形变

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9楼2021-10-05 22:21:48
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海子子2楼
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tzynew4楼
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leiyu69319楼
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