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jkszd

新虫 (初入文坛)


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用vasp进行纳米带吸附分子的优化时,吸附分子发生较大形变
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描述:我在对纳米带进行吸附分子的相关计算时,发现在优化阶段,所吸附的分子发生较大形变。
在图1里我将吸附分子水平放在纳米带表面,但优化得到图2发现原来的分子发生较大形变,原来的平面环发生高低起伏,环外连接的原子也发生改变。
之前进行优化时吸附在纳米带上的分子未发生明显形变(原来是二维分子,优化后还是二维分子),如图3图4就是另外一个纳米带吸附分子体系优化前后的结构图,吸附分子仅在纳米带表面发生倾斜。
问题:这种形变是否是正常的?如果不正常,如何在优化过程中仅让吸附分子在纳米带表面发生移动,而不发生形变?求大佬解答

用vasp进行纳米带吸附分子的优化时,吸附分子发生较大形变


用vasp进行纳米带吸附分子的优化时,吸附分子发生较大形变-1


用vasp进行纳米带吸附分子的优化时,吸附分子发生较大形变-2


用vasp进行纳米带吸附分子的优化时,吸附分子发生较大形变-3


用vasp进行纳米带吸附分子的优化时,吸附分子发生较大形变-4


用vasp进行纳米带吸附分子的优化时,吸附分子发生较大形变-5


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jkszd

新虫 (初入文坛)


放错图了,图1,2和图3,4重复了,图5,6才是文字描述中的图3,4

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3楼2021-10-05 22:08:36
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chaofanc

新虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我觉得是正常的,我做过类似的,也会发生形变

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9楼2021-10-05 22:21:48
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海子子2楼
2021-10-05 22:07   回复  
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tzynew4楼
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lovely171210楼
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nono200911楼
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ke19519518楼
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leiyu69319楼
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JameSolar20楼
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未语花21楼
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wmdjnc22楼
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