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312926

新虫 (初入文坛)

[求助] 土壤微生物分析中数据偏低怎么办

我采集的土壤样本储存在-20℃一个月后进行的分析,公司反馈的数据中个别样本的coverage是0.93,基于97%分析时,相关样本出现缺失怎么办,是不是应该抛弃?
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xiayuran

银虫 (小有名气)

是自己提取的核酸然后送的测序公司吗?还是直接送的土壤样本让公司直接提取再测序的,最好看一看核酸的质检报告,浓度以及电泳图,看一下是不是核酸提取有问题,毕竟如果是生物公司提取的话,自动提取仪提取复杂样本难度太大,提取效果不能保证。
2楼2021-11-08 13:18:32
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xiayuran

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiayuran at 2021-11-08 13:18:32
是自己提取的核酸然后送的测序公司吗?还是直接送的土壤样本让公司直接提取再测序的,最好看一看核酸的质检报告,浓度以及电泳图,看一下是不是核酸提取有问题,毕竟如果是生物公司提取的话,自动提取仪提取复杂样本 ...

正常土壤样本放入冰箱一个月是完全没有问题的
3楼2021-11-08 13:21:06
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18787065176

新虫 (著名写手)

不是-70嘛?你再送一份土试一下

发自小木虫IOS客户端
4楼2022-10-10 16:02:50
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