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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 土壤微生物分析中数据偏低怎么办
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312926

新虫 (初入文坛)

[求助] 土壤微生物分析中数据偏低怎么办

我采集的土壤样本储存在-20℃一个月后进行的分析，公司反馈的数据中个别样本的coverage是0.93，基于97%分析时，相关样本出现缺失怎么办，是不是应该抛弃？
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1楼 2021-09-24 18:59:11
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xiayuran

银虫 (小有名气)
是自己提取的核酸然后送的测序公司吗？还是直接送的土壤样本让公司直接提取再测序的，最好看一看核酸的质检报告，浓度以及电泳图，看一下是不是核酸提取有问题，毕竟如果是生物公司提取的话，自动提取仪提取复杂样本难度太大，提取效果不能保证。
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2楼2021-11-08 13:18:32
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xiayuran

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xiayuran at 2021-11-08 13:18:32
是自己提取的核酸然后送的测序公司吗？还是直接送的土壤样本让公司直接提取再测序的，最好看一看核酸的质检报告，浓度以及电泳图，看一下是不是核酸提取有问题，毕竟如果是生物公司提取的话，自动提取仪提取复杂样本 ...

正常土壤样本放入冰箱一个月是完全没有问题的
赞一下 回复此楼
3楼2021-11-08 13:21:06
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18787065176

新虫 (著名写手)
不是-70嘛？你再送一份土试一下

发自小木虫IOS客户端
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4楼2022-10-10 16:02:50
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