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Cell | 震撼发布!迄今为止规模最大的小鼠蛋白互作组
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文献来源:Skinnider, Michael A., et al. "An atlas of protein-protein interactions across mouse tissues." Cell 184.15 (2021): 4073-4089. PMID: 34214469 作者:头秃的小师弟 导语 亲爱的小伙伴们,今天的文章是一篇来自Cell主刊的文章,主题是关于蛋白-蛋白互作的检测,这也是一个经久不衰的话题了。现有方法的主要挑战在于难以实现组织特异(tissue-specific)的大规模检测。为此,本文改进了先前发表的技术,实现了小鼠大规模蛋白互作的检测。接下来废话不多说,快来看看本文到底说了个啥 摘要 蛋白分子之间的动态物理互作(physical interactions) 是细胞执行生物学功能的基本方式。通常人们可通过高通量技术(如酵母双杂交、蛋白质微阵列等)构建蛋白-蛋白互作图谱。然而,现有技术很难捕捉动态的互作过程。本文开发了一种基于稳定同位素标记法和蛋白相关性检测的蛋白互作预测方法(protein correlation profiling with stable isotope labeling of mammals, PCP-SILAM)。通过该技术,本研究测定了小鼠7种组织中共125000对蛋白互作对。通过比对不同组织的互作网络,作者发现互作蛋白间重连(rewiring)现象十分频繁,并且疾病相关蛋白趋于更频繁地发生重连。本研究所开发的技术可应用于组织特异的蛋白互作组检测,这使得从蛋白组大规模层面上研究器官组织对生理和病理刺激条件的响应成为可能。 欢迎关注公众号“大师兄的文献笔记” 注:未经许可禁止转载!英文原文↓↓↓: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0092867421007042 |
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