应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 设计引物求助
51/1返回列表
查看: 1400  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

忘记将来

木虫 (正式写手)

[交流] 设计引物求助

我用primer peimer5 设计引物时，下游引物插入的酶切位点的序列要输入正常序列还是反向互补序列？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-08-18 20:54:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

synhily

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
举个例子来说：
上游引物5-AATTCCGGAATTCCGG-3
下游引物5-ATCGATCGATCGATCG-3

现在要在上下游分别加上HindIII和BamHI保护碱基，那么从网上可以查到：
HindIII的酶切位点为：AAGCTT，保护碱基为：CCC
BamHI的酶切位点为：GGATCC，保护碱基为：CGC

那么加上保护碱基及酶切位点引物为：
上游：5-CCC   AAGCTT   AATTCCGGAATTCCGG-3
下游：5-CGC   GGATCC   ATCGATCGATCGATCG-3
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2009-08-19 09:53:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
你说呢？其实你只要试一下就知道了或者画个简图就知道了，这样保证你印象深刻啊
primer有个自动分析酶切位点的功能，第一次用需要你自己导入所要分析的酶
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2009-08-18 21:18:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

synhily

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
上下游引物设计好了以后，加入酶切位点的时候，从5到3的方向加上酶切位点即可。在酶切位点的外部（5端）加上保护碱基。

我明白你说的意思，保护碱基不用反向互补的加。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2009-08-19 09:45:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaocy8903

木虫 (知名作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
酶切位点是回文序列
反相互补序列不变
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2009-08-19 09:52:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 HFw0lei2R37i 2026-08-14 8/400 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-14 22:32 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +23 医学老男孩 2026-08-13 49/2450 2026-08-14 20:02 by zhaifei
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +5 Ldrop2023 2026-08-13 5/250 2026-08-14 18:48 by ssxclkj
[基金申请] filecode +6 cratir 2026-08-14 10/500 2026-08-14 18:29 by 笑叹辞穷
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[基金申请] 好奇怪的filecode +6 布布和一二 2026-08-08 7/350 2026-08-14 13:38 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[论文投稿] 职称评审，求友友推荐见刊最快的期刊 +5 工厂打螺丝 2026-08-08 5/250 2026-08-14 11:03 by 玖戈弋
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭