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nessmeimei

银虫 (初入文坛)

[交流] 请教如何确定一个肽段只来源于某个蛋白而不是其它蛋白

麻烦请教各位前辈,如何确定一个肽段只来源于某个蛋白而不是其它蛋白,也就是多肽的特异性问题。十分感谢!

感谢各位前辈的回复!
肽段是从一个标准蛋白上酶切得到,用质谱检测的。从质谱上看,对某个质荷比的肽段感兴趣,但是不知道是不是别的蛋白也能切出这样的peptide。那样的话,我找到的这个肽就失去特异性的价值了。
我新手,前辈们提到的blast是什么?
感激again!

[ Last edited by amisking on 2009-8-19 at 21:13 ]
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cancanyeah

铜虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
你的肽段是怎么得到的啊?楼主说的不太清楚哦
2楼2009-08-19 09:00:36
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)

做个BLAST
3楼2009-08-19 09:02:37
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zhangsuobing

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
最简单快捷的方法作个blastp看看
4楼2009-08-19 09:23:02
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nessmeimei

银虫 (初入文坛)

感谢各位前辈的回复!
肽段是从一个标准蛋白上酶切得到,用质谱检测的。从质谱上看,对某个质荷比的肽段感兴趣,但是不知道是不是别的蛋白也能切出这样的peptide。那样的话,我找到的这个肽就失去特异性的价值了。
我新手,前辈们提到的blast是什么?
感激again!
5楼2009-08-19 21:12:09
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+2,VIP+0):欢迎发帖交流! 8-19 21:36
不是氨基酸序列的话不能做BLAST
6楼2009-08-19 21:33:59
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bioinflab

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by nessmeimei at 2009-8-19 21:12:
感谢各位前辈的回复!
肽段是从一个标准蛋白上酶切得到,用质谱检测的。从质谱上看,对某个质荷比的肽段感兴趣,但是不知道是不是别的蛋白也能切出这样的peptide。那样的话,我找到的这个肽就失去特异性的价值了 ...

你需要知道其序列,然后就可以做blast了。
7楼2009-08-20 19:23:59
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nessmeimei

银虫 (初入文坛)

多谢!
8楼2009-08-23 19:23:54
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