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拉克丝11

新虫 (小有名气)

[求助] 关于构象转化,ECD 已有1人参与

我一般是先花chemdraw2D结构,然后用chemdraw3D打开(这时候可能需要小小调整),然后通过openbabel中的confab进行xyz左边转换,这时候可能搜索不到构象,也可能一个,多个构象(麻烦解释下构象数目问题)。我自己做了一个化合物和它对映异构体的ECD,发展结果是一样的,是我做错了吗?

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cngdkpmg

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

对映体ECD应该镜像对称,可能是构象搜索问题。百度搜索【微信学术交流群】进群问问吧。或者搜索【构象搜索教程 小分子构象搜索】。有三种搜索方式,针对不同类型的结构。
6楼2021-11-18 16:10:29
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拉克丝11

新虫 (小有名气)

输入的坐标明明不一样,得到的ECD却一样

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2楼2021-08-11 10:33:56
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拉克丝11

新虫 (小有名气)

这是一个化合物的输入文件,大佬帮忙看一下哪里出错了吗?
关于构象转化,ECD



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3楼2021-08-11 11:03:08
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拉克丝11

新虫 (小有名气)

4楼2021-08-11 11:03:44
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