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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 请问有用lammps做蛋白质模拟的小伙伴吗？
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jackyyyy

新虫 (初入文坛)

[交流] 请问有用lammps做蛋白质模拟的小伙伴吗？ 已有3人参与

有些关于处理数据的问题想要请教一下
或者有相关方向的也可以交流一下

发自小木虫Android客户端
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1楼 2021-07-28 10:19:24
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
做蛋白质模拟用gromacs或者NAMD更好，数据分析处理的工具更多。lammps做生物分子模拟时很多信息都被删掉了。
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jackyyyy
3楼2021-09-02 14:38:47
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查看全部 5 个回答

小林9391

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
需要计算资源吗,可联系测试
赞一下 回复此楼
2楼2021-07-29 14:55:14
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jackyyyy

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2021-09-02 14:38:47
做蛋白质模拟用gromacs或者NAMD更好，数据分析处理的工具更多。lammps做生物分子模拟时很多信息都被删掉了。

好的，谢谢回复。
只是老师希望我们用lammps做蛋白质模拟，也很为难
赞一下 回复此楼
4楼2021-09-02 16:33:59
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柒喜呦

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你好，我想问一下你的蛋白质模型是怎么用lammps构建的呀？我目前只有pdb文件，可我想要得到data文件
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5楼2022-09-18 17:25:21
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