| 查看: 4452 | 回复: 5 | ||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者qianyunjiu将赠送您 30 个金币 | ||
qianyunjiu新虫 (小有名气)
|
[求助]
DMOL3计算吸附位
|
|
|
使用DMOL3模块计算MOFs中有机配体对二甲苯的吸附，想问一下如何确定的吸附位点，我目前是直接把二甲苯模型copy到有机配体附近，然后进行结构优化，但计算失败。想问一下大佬们是什么原因，或者是不可以这样算。输入文件、输出文件的末尾部分如下： 输入文件： # Task parameters Calculate optimize Opt_energy_convergence 1.0000e-04 Opt_gradient_convergence 2.0000e-02 A Opt_displacement_convergence 5.0000e-02 A Opt_iterations 100 Opt_max_displacement 0.3000 A Opt_coordinate_system cartesian Initial_hessian improved Symmetry off Max_memory 2048 File_usage smart Scf_density_convergence 1.000000e-04 Scf_charge_mixing 2.000000e-01 Scf_spin_mixing 5.000000e-01 Scf_diis 6 pulay Scf_iterations 100 # Electronic parameters Spin_polarization unrestricted Charge 0 Basis dnp Pseudopotential vpsr Functional pbe Aux_density hexadecapole Dftd G06 Integration_grid fine Occupation thermal 0.0500 Cutoff_Global 3.5000 angstrom # Calculated properties 输出文件： Warning: molecule has been put into center of geometry coordinate system Translated by 22.11734659977801 33.38771086531930 9.96617519146394 Translations and Rotations Projected Out of Hessian Cycle Total Energy Energy change Max Gradient Max Displacement opt== 3 -7755.9111380 -0.0658368 0.033689 0.075431 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ End Getting New Geometry ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Total Energy Binding E Cnvgnce Time Iter Ef -7755.805213Ha -17.4411506Ha 7.13E-03 22.2m 1 Ef -7755.811509Ha -17.4474473Ha 1.32E-02 22.4m 2 Ef -7755.810076Ha -17.4460141Ha 7.74E-03 22.6m 3 Ef -7755.811852Ha -17.4477898Ha 1.24E-02 22.8m 4 Ef -7755.810722Ha -17.4466602Ha 5.09E-03 23.0m 5 Ef -7755.810484Ha -17.4464221Ha 4.13E-03 23.2m 6 Ef -7755.810156Ha -17.4460942Ha 1.41E-03 23.5m 7 Ef -7755.810026Ha -17.4459640Ha 2.53E-03 23.7m 8 Ef -7755.810041Ha -17.4459788Ha 1.26E-03 23.9m 9 Ef -7755.810059Ha -17.4459971Ha 1.80E-03 24.1m 10 Ef -7755.810000Ha -17.4459380Ha 8.30E-04 24.3m 11 Ef -7755.809971Ha -17.4459089Ha 4.94E-04 24.5m 12 DMol3.pl message: DMol3 job finished in 0 hr 24 min 47 sec. |
回复此楼» 猜你喜欢
有没有接收比较快的sci期刊呀，最好在一个月之内的，研三孩子求毕业
已经有4人回复
-
294求调剂
已经有3人回复
-
恳请有学校收留
已经有8人回复
-
一志愿华中农业071010，320求调剂
已经有17人回复
-
收到复试调剂但是去不了
已经有5人回复
-
297，工科调剂?
已经有4人回复
-
291求调剂
已经有9人回复
-
300求调剂
已经有11人回复
-
22专硕求调剂
已经有12人回复
-
材料相关专业344求调剂双非工科学校或课题组
已经有25人回复
2楼2021-07-16 16:30:20
3楼2021-07-16 16:46:09
郭同学
金虫 (著名写手)
- 应助: 27 (小学生)
- 金币: 4361.4
- 散金: 101
- 红花: 12
- 帖子: 1131
- 在线: 61.2小时
- 虫号: 5358557
- 注册: 2016-12-15
- 性别: GG
- 专业: 化学工程及工业化学
4楼2021-07-31 19:41:46
郭同学
金虫 (著名写手)
- 应助: 27 (小学生)
- 金币: 4361.4
- 散金: 101
- 红花: 12
- 帖子: 1131
- 在线: 61.2小时
- 虫号: 5358557
- 注册: 2016-12-15
- 性别: GG
- 专业: 化学工程及工业化学
5楼2021-07-31 19:42:05
6楼2021-08-24 19:52:19
20
