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hsiaochin

新虫 (小有名气)

[求助] 微生物小白提问,请问各位宏转录组的差异表达基因分析和差异表达通路分析如何进行?

可能我的问题实在是比较宽泛,但是我在进行转录组学的分析时遇到了蛮大的阻碍,请各位大神指导。

第一,gene id如何进行转换?因为我的测序结果里gene id一栏全是trinity开头的,而且百度之后到DAVID还有另外几个网站转换发现都没有这个格式的,这是我的第一个问题。

第二,在我的测序结果文件夹里有diff gene, diff kegg, diff go还有GeneExpress几个excel表格,我能看得懂diff gene这个而且也用这个画出了火山图,但是其他几个表格里除了GeneExpress都没有具体的数,只有最后一行显示了上下调,请问这些如何进行分析呢?

希望各位大佬不吝赐教,实在不行又只能去找测序公司了呜呜呜
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姜姜姜姜月

铜虫 (初入文坛)

作为一个过来人,我觉得你要是着急的话,那还是找公司分析吧,自己搞会比较慢
行到水穷处,坐看云起时。
2楼2021-05-26 10:25:36
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