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欣芮_7434

铜虫 (初入文坛)

[求助] 石墨烯已有1人参与

二维材料计算吸附时,如石墨烯,需要将单层石墨烯放在格子中间吗,那之前建立的真空层会不会影响啊,建立了15 埃米的真空层,单层材料移动到中间,那真空层还是15 埃米吗???
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xiaoyukaka

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
看你单胞在真空层方向上的长度c,如果保持c=15A,把石墨烯移动到中间,上下真空层各7.5A,但由于结构是周期性的,近邻单胞中石墨烯上下真空层也是7.5A,那么石墨烯层与层之间的真空层还是15A,没有影响的。

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2楼2021-05-12 10:19:00
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欣芮_7434

铜虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaoyukaka at 2021-05-12 10:19:00
看你单胞在真空层方向上的长度c,如果保持c=15A,把石墨烯移动到中间,上下真空层各7.5A,但由于结构是周期性的,近邻单胞中石墨烯上下真空层也是7.5A,那么石墨烯层与层之间的真空层还是15A,没有影响的。


谢谢解答,这种二维材料的优化是否要放到中间呢,我看博士论文里说,是扩胞加真空后,将单层的材料向上平移到盒子中间位置,这样的真空层还是15 A??我再吸附原子可以吗,不会距离太近?
3楼2021-05-12 14:11:45
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xiaoyukaka

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 欣芮_7434 at 2021-05-12 14:11:45

谢谢解答,这种二维材料的优化是否要放到中间呢,我看博士论文里说,是扩胞加真空后,将单层的材料向上平移到盒子中间位置,这样的真空层还是15 A??我再吸附原子可以吗,不会距离太近?...

这样真空层还是15A。这个距离一般情况下是没问题的,具体要看你吸附后单层的厚度,如果你不放心或没有把握,可以把真空层再增大一些,比如20A或30A,不过增大后可能会影响计算精度和计算量,你可以测试一下。
4楼2021-05-12 14:22:37
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欣芮_7434

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xiaoyukaka at 2021-05-12 14:22:37
这样真空层还是15A。这个距离一般情况下是没问题的,具体要看你吸附后单层的厚度,如果你不放心或没有把握,可以把真空层再增大一些,比如20A或30A,不过增大后可能会影响计算精度和计算量,你可以测试一下。...

我还想问下,我再石墨烯上吸附了一个氧气分子解离,过渡态计算,可是初末态优化后,他们的晶格常数变化大,没办法找到过渡态???怎么办,固定晶格常数优化吗,那样结构还合理吗??
5楼2021-05-12 14:49:32
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xiaoyukaka

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 欣芮_7434 at 2021-05-12 14:49:32
我还想问下,我再石墨烯上吸附了一个氧气分子解离,过渡态计算,可是初末态优化后,他们的晶格常数变化大,没办法找到过渡态???怎么办,固定晶格常数优化吗,那样结构还合理吗??...

这方面我没做过,不了解哈。
6楼2021-05-13 17:19:40
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欣芮_7434

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xiaoyukaka at 2021-05-13 17:19:40
这方面我没做过,不了解哈。...

好的,谢谢你
7楼2021-05-14 19:30:39
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123dingyc

新虫 (知名作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 欣芮_7434 at 2021-05-12 14:49:32
我还想问下,我再石墨烯上吸附了一个氧气分子解离,过渡态计算,可是初末态优化后,他们的晶格常数变化大,没办法找到过渡态???怎么办,固定晶格常数优化吗,那样结构还合理吗??...

固定晶格

发自小木虫IOS客户端
8楼2021-05-16 13:06:52
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计算材料6

新虫 (正式写手)

盒子上下随便放,周期的不影响

发自小木虫IOS客户端
9楼2021-05-16 19:38:14
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欣芮_7434

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 123dingyc at 2021-05-16 13:06:52
固定晶格
...

是Modify a abc ABR吗?
10楼2021-05-18 17:16:08
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