应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » vina分子对接，box模型的判断
31/1返回列表
查看: 1116  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【悬赏金币】回答本帖问题，作者410666321将赠送您 10 个金币

410666321

木虫 (正式写手)

毛毛虫

[求助] vina分子对接，box模型的判断 已有1人参与

auto dock vina做分子对接时，请问怎样判断对接box选择是否准确？原配体与受体打分差值怎样算准确？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
离该离，合该合，世间姻缘当看破。一世夫妻百世恩，今生憎会前世错。无情不来，冤亲难躲，烦什么？
1楼 2021-05-08 17:47:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

学员0Vc46c

新虫 (小有名气)
可以吧或者box选择大一点  对接结果里有20种结合位置  看自己需要哪种

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2021-05-16 23:41:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cngdkpmg

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

box只要足够大，把口袋包裹起来就可以了。百度搜索【蛋白/核酸/多肽-小分子对接(Vina)】，看看教程怎么说的吧。原配体对接是否准确（成功）应该看RMSD，打分倒是其次。一般认为打分＜ -4.0 kcal/mol才算有结合力。那篇教程有讲到。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2021-11-18 16:02:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 410666321 的主题更新
31/1返回列表
不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭