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frank_xiao

金虫 (小有名气)

[求助] Li+与EC(碳酸乙烯酯)结合能计算 已有1人参与

本人开始学习计算,想计算Li+与不同溶剂分子的结合能

比如要计算Li+与EC的结合能,直接可以从gaussian view读出charge(1) 和spin(single)值,使用什么method和 basis set比较好,新手还望大佬多赐教,最后能给出简单的input文件,万分感谢,求大佬救小弟与水火之中
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paramecium86

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+5 2021-04-27 14:10:16
frank_xiao: 金币+50, ★★★很有帮助 2021-05-11 20:42:34
结合能本身没有什么特别的。就是用结合之后整体的能量 分别减去 Li+ 和 EC它们单独的能量即可。这里的能量是看你自己的需要需要哪种,就计算哪种。电子能(纯理论分析) 普通的结构优化就可以得到, 跟实验的键”能”对应的一般是 要计算分子的焓 ,这就需要用频率计算得到热力学校正量。 有些情况也会用到结合自由能,这个也是热力学量量。也是由频率计算给出。


至于用什么计算的方法。 几何优化和频率计算 可以就用B3LYP/6-311G(d)  EM=GD3BJ   至于后续要不要用更高级别的计算方法去计算更精确的电子能就看你个人需求。


但是从你的描述来看,你高斯都还没有入门,还没有到需要选择计算方法和基组的地步。我上面说的如果也都还看不懂在说什么。那就赶紧入门一下高斯。(入门高斯,几乎是“入门量子化学计算”的必经之路)

怎么入门可以看 https://muchong.com/t-14242735-1 我这个教程的前言,当然教程内容本身也是入门的一些内容,但是完全都还不会用高斯的时候看这个教程本身用处不大。

官方的教程 我这个帖子 https://muchong.com/t-14151335-1 有分享。 建议是跟着第二版 坚持看上前几章 跟着里面的练习和给的例子文件,入门高斯肯定没啥问题。  如果倾向于看中文,民间缩减版的中文的第二版也可以。入门也还够。第三版虽然例子更多也有官方中文版不过里面纰漏比第二版多得多。新手容易被带偏了。

至于输入文件可以给一个 不过在真正入门前用处也不大的。入门之后这种类型的计算自己也能信手拈来的

比如一个分子的几何优化和频率计算

%nproc=16
%mem=20GB
%chk=output_explain_opt_freq.chk
#p opt freq b3lyp/6-311G(D) EM=GD3BJ

h2o opt freq

0 1
O                 -5.61694298    0.21178637    0.00000000
H                 -4.65694298    0.21178637    0.00000000
H                 -5.93739757    1.11672220    0.00000000
2楼2021-04-26 17:48:10
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frank_xiao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2021-04-26 17:48:10
结合能本身没有什么特别的。就是用结合之后整体的能量 分别减去 Li+ 和 EC它们单独的能量即可。这里的能量是看你自己的需要需要哪种,就计算哪种。电子能(纯理论分析) 普通的结构优化就可以得到, 跟实验的键”能 ...

我以前有计算过分子的LUMO和HOMO值,麻烦再问一下,问什么加 EM=GD3BJ,这个是必须的吗?
3楼2021-05-11 20:42:15
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paramecium86

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【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by frank_xiao at 2021-05-11 07:42:15
我以前有计算过分子的LUMO和HOMO值,麻烦再问一下,问什么加 EM=GD3BJ,这个是必须的吗?...

EM=GD3BJ 是给当前的泛函加入色散校正。 弥补一些比较老的泛函(比如 B3LYP)没有考虑色散作用的缺点。 一般来说这个校正加上算出来结果会好一些。而且也不增加计算量。所以可以常规带着这个关键词。 尤其是最近这一两年,带着色散校正成为主流了。 不过倒是加或者不加对于HOMO LUMO来说影响应该是不大。
4楼2021-05-12 00:41:38
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5楼2021-06-12 22:38:30
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