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贾贾

金虫 (小有名气)

[交流] 【其他】isovalue

画分子轨道图时有个isovalue值?这是什么意思?该如何取这个值呢?

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 16:24 ]
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lerel12345

木虫 (职业作家)

★ ★
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gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢 9-29 22:36
过路,顶一个


月有阴晴圆缺 星星一直在眨眼
2楼2009-09-29 19:16:25
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
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gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢 9-29 22:36
好象是标准值,或等值。
3楼2009-09-29 19:49:49
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ZJboy

木虫 (著名写手)

★ ★
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erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 10-8 09:01
总之这个数值越大,静电势面的轮廓越小,这个数值越小,静电势面的轮廓越大。在文献里好像常用isovalue=0.02,但也不绝对。
4楼2009-10-07 15:57:44
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贾贾

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by ZJboy at 2009-10-7 15:57:
总之这个数值越大,静电势面的轮廓越小,这个数值越小,静电势面的轮廓越大。在文献里好像常用isovalue=0.02,但也不绝对。

Thank you!
5楼2009-10-07 16:23:16
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jjf_sxnu

铜虫 (正式写手)

★ ★
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erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 10-8 09:01
isovalue其实就是等密度面的值,当然,这个值越大,就表面等密度面上电子密度越大,自然也就靠近核了,看上去就小了许多。如果这个值小,自然离核就会很远,看上去就大一些。按照Bader的建议,最好取值0.02。
6楼2009-10-07 17:46:22
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tiechong

金虫 (著名写手)


erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 10-8 09:01
就用高斯里默认的值,不要改动就可以了,好像就是0.02
7楼2009-10-08 08:52:43
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ZJboy

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by tiechong at 2009-10-8 08:52:
就用高斯里默认的值,不要改动就可以了,好像就是0.02

The default isovalue may be 0.004.
8楼2009-10-08 09:20:46
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★
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yjcmwgk(金币+1,VIP+0): 10-8 13:08
对于研究不同的属性,等值面的选取是不同的。
对于显示分子轨道,默认的0.02并无特殊意义,只是为了使等值面收缩程度适中便于观看。
对于电子密度,0.001等值面的特点是可以近似表达气相分子分子的VDW表面。
对于分子静电势的研究,我们一般研究的是它在VDW表面的分布。所以一般不直接用它的等值面,而是将分子静电势数据map到电子密度为0.001的表面。
9楼2009-10-08 12:34:45
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贾贾

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by sobereva at 2009-10-8 12:34:
对于研究不同的属性,等值面的选取是不同的。
对于显示分子轨道,默认的0.02并无特殊意义,只是为了使等值面收缩程度适中便于观看。
对于电子密度,0.001等值面的特点是可以近似表达气相分子分子的VDW表面。
对 ...

谢谢了!
10楼2009-10-08 13:44:08
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