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这周你汇报

新虫 (小有名气)

[求助] 分子信标探针设计,求大神解答疑惑。

大家好,请问有熟悉分子信标的大神吗?想请教怎么设计探针?我最近在做等温扩增,反应中要加入分子探针。已经设计了引物也blast验证引物的特异性。我按照文献里用的OligoAnalyzer Tool设计的探针,输入目标序列后,请问 右边的Parameter sets应该选SpecSheet 还是qPCR 呀?两个我都试了,Tm值都不超过50,设计的探针应该不行吧?
还是说我应该从头开始,先设计探针再设计引物?因为和PCR不太一样,现在一头雾水。求大神解惑,万分感谢!

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琛琛:

新虫 (正式写手)

primerexplorer暂时没有设计探针的功能,但在扩增的目的序列中手动挑选10-15bp作为探针是否可行

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2楼2021-04-15 08:07:19
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这周你汇报

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 琛琛: at 2021-04-15 08:07:19
primerexplorer暂时没有设计探针的功能,但在扩增的目的序列中手动挑选10-15bp作为探针是否可行

非常感谢!是在接近外引物F3的扩增产物序列中手动找吗?

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3楼2021-04-15 10:11:34
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