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lhh98330

新虫 (小有名气)

[求助] 请问bowtie2如何输出unpairedreads?

bowtie2 -x genome.fa  -1 SRR8114414_1.fastq -2 SRR8114414_2.fastq -q --sensitive-local -p 8 --un unmap.fq -S hit.sam
我用上述这个命令进行map时,unmap.fq总是0Kb,但是最终结果显示有11%左右未比对上,请大佬指点一二。
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祝福
2楼2021-04-26 14:12:44
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