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贾贾

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】分子坐标问题

建了一个二维分子模型，在xy坐标上，可是优化完后变成在yz坐标上了，请问这个正常吗？对结果会不会有影响？有没有办法使坐标抽不变呢？
谢谢大家
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1楼 2009-08-08 22:03:22
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dummy1

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-9 19:58
一般加上的对就代表分子不具有对称性，能量肯定比你原来计算的偏低，如果你不分析对称性的话应该没什么问题，你可以两个结果对比以下看看。
引用回帖:
Originally posted by 贾贾 at 2009-8-8 22:28:

加nosymm优化会对结果有影响吗？

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6楼2009-08-09 14:57:52
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recoli

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-8 22:35
坐标轴没关系的，分子还是那个分子。
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2楼2009-08-08 22:12:49
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dummy1

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-8 22:35
优化的时候加上nosymm坐标就不会转了。
引用回帖:
Originally posted by 贾贾 at 2009-8-8 22:03:
建了一个二维分子模型，在xy坐标上，可是优化完后变成在yz坐标上了，请问这个正常吗？对结果会不会有影响？有没有办法使坐标抽不变呢？
谢谢大家

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3楼2009-08-08 22:22:49
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贾贾

金虫 (小有名气)
这样啊
结构是没问题，可是优化后的结构就要自己手动调整使其更好的直观呈现，以便保存结构图，这样比较麻烦，有没有别的方法呢
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4楼2009-08-08 22:25:21
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