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听枫沛凝

新虫 (正式写手)

[求助] easyfig软件使用问题

各位老师好，最近做了全基因组测序，想把结果用easyfig软件来进行基因环境比较，但是这个软件在运行blast环节的时候出现了点问题，情况如下：
       用网站上面的例子1运行，如果用自带的blastn.out文件（大约3kb）就可以地出来正确的图片，但是如果用在软件中自己生成的blast.out软件，就是0kb，画出来的图也是只有基因，没有阴影部分的比较，所以比较困惑，如果要用这个软件blast的话，怎么操作？或者是否有其他软件可以生成这种blast.out的文件?
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1楼 2021-04-05 21:35:59
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nanhu1984

银虫 (正式写手)
自己下载一个blast，安装后进行本地blastn分析，设置结果展示格式为表格形式，即可得到blastn.out文件

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听枫沛凝
https://www.microbialgenomic.cn/
2楼2021-04-05 22:36:13
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听枫沛凝

新虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by nanhu1984 at 2021-04-05 22:36:13
自己下载一个blast，安装后进行本地blastn分析，设置结果展示格式为表格形式，即可得到blastn.out文件

谢谢老师！
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3楼2021-04-08 13:56:57
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风恋邱

铁虫 (正式写手)
楼主您好，我安装运行easyfig会出现爆炸弹窗，你出现过嘛？是如何解决的呢？求指导，谢谢。
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4楼2022-06-17 22:49:56
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风恋邱

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by nanhu1984 at 2021-04-05 22:36:13
自己下载一个blast，安装后进行本地blastn分析，设置结果展示格式为表格形式，即可得到blastn.out文件

老师，您好，我的easyfig一运行就会出现爆炸弹窗，这个怎么解决呀，就差这个图了，求帮忙，谢谢
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5楼2022-06-21 00:19:06
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nanhu1984

银虫 (正式写手)
这个软件没用过，你可以考虑用我们开发的Gcluster软件来绘制基因簇比较图，功能和easyfig差不多

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https://www.microbialgenomic.cn/
6楼2022-06-29 14:29:26
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0077110088

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by nanhu1984 at 2022-06-29 14:29:26
这个软件没用过，你可以考虑用我们开发的Gcluster软件来绘制基因簇比较图，功能和easyfig差不多

您好您好 我在linux安装了Gcluster  但是在准备输入文件的地方 遇到了一些困难 就是首先Genbank文件 因为我的噬菌体大部分都是自己分离的测序得到的 所以没有从NCBI上下载下来的那么规范 不清楚基因组必须带的注释包括哪些呀？

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7楼2022-08-03 16:02:02
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0077110088

新虫 (初入文坛)
您好您好 请问这个问题您后面怎么解决的呀？是从NCBI本地化blast嘛？但是我本地化也遇到了问题

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8楼2022-08-03 16:04:30
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火热冬天

新虫 (小有名气)
保存路径不要有特殊字符和中文

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9楼2023-05-11 15:10:39
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