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听枫沛凝

新虫 (正式写手)

[求助] easyfig软件使用问题

各位老师好,最近做了全基因组测序,想把结果用easyfig软件来进行基因环境比较,但是这个软件在运行blast环节的时候出现了点问题,情况如下:
       用网站上面的例子1运行,如果用自带的blastn.out文件(大约3kb)就可以地出来正确的图片,但是如果用在软件中自己生成的blast.out软件,就是0kb,画出来的图也是只有基因,没有阴影部分的比较,所以比较困惑,如果要用这个软件blast的话,怎么操作?或者是否有其他软件可以生成这种blast.out的文件?
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nanhu1984

银虫 (正式写手)

自己下载一个blast,安装后进行本地blastn分析,设置结果展示格式为表格形式,即可得到blastn.out文件

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https://www.microbialgenomic.cn/
2楼2021-04-05 22:36:13
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听枫沛凝

新虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by nanhu1984 at 2021-04-05 22:36:13
自己下载一个blast,安装后进行本地blastn分析,设置结果展示格式为表格形式,即可得到blastn.out文件

谢谢老师!
3楼2021-04-08 13:56:57
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风恋邱

铁虫 (正式写手)

楼主您好,我安装运行easyfig会出现爆炸弹窗,你出现过嘛?是如何解决的呢?求指导,谢谢。
4楼2022-06-17 22:49:56
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风恋邱

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by nanhu1984 at 2021-04-05 22:36:13
自己下载一个blast,安装后进行本地blastn分析,设置结果展示格式为表格形式,即可得到blastn.out文件

老师,您好,我的easyfig一运行就会出现爆炸弹窗,这个怎么解决呀,就差这个图了,求帮忙,谢谢
5楼2022-06-21 00:19:06
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nanhu1984

银虫 (正式写手)

这个软件没用过,你可以考虑用我们开发的Gcluster软件来绘制基因簇比较图,功能和easyfig差不多

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https://www.microbialgenomic.cn/
6楼2022-06-29 14:29:26
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0077110088

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by nanhu1984 at 2022-06-29 14:29:26
这个软件没用过,你可以考虑用我们开发的Gcluster软件来绘制基因簇比较图,功能和easyfig差不多

您好您好 我在linux安装了Gcluster  但是在准备输入文件的地方 遇到了一些困难 就是首先Genbank文件 因为我的噬菌体大部分都是自己分离的测序得到的 所以没有从NCBI上下载下来的那么规范 不清楚基因组必须带的注释包括哪些呀?

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7楼2022-08-03 16:02:02
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0077110088

新虫 (初入文坛)

您好您好 请问这个问题您后面怎么解决的呀?是从NCBI本地化blast嘛?但是我本地化也遇到了问题

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8楼2022-08-03 16:04:30
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火热冬天

新虫 (小有名气)

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9楼2023-05-11 15:10:39
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