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关于restart的问题
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最近在使用restart时出现了一个比较问题，一直没想明白。有没有哪位大佬路过能帮忙看一下 有一组对比，分为A组B组。 A组计算过程：在一个in文件里包含弛豫和后续的计算。 B组计算过程：先弛豫，存一个restart二进制文件，再在一个in文件里将这个文件作为初始模型直接进行后续的计算。 具体代码如下： B组： 存restart文件 shell mkdir initial #--------------------------DEFINITION------------------- units metal dimension 3 boundary s s p atom_style atomic read_data Cu.data pair_style eam/alloy pair_coeff * * Cu01.eam.alloy Cu #------------------------equilibrium--------------------- timestep 0.002 velocity all create 300.0 12345 min_style cg minimize 1e-18 1e-18 100000 100000 fix 1 all nve fix 2 all temp/rescale 10 300.0 300.0 10.0 1.0 dump 1 all custom 8000 ./initial/relax.*.dump id type x y z run 8000 undump 1 write_restart ./initial/restart.equil 计算过程 shell mkdir config read_restart restart.equili pair_style eam/alloy pair_coeff * * Cu01.eam.alloy Cu reset_timestep 0 timestep 0.002 dump 2 all custom 1 ./config/shear.*.dump id type x y z #c_eng c_1 dump_modify 2 delay 8875 fix 3 all deform 1 z scale 0.92 remap x units box run 9001 ----------------------------------------------------------------------------------------------- A组 shell mkdir initial shell mkdir config #--------------------------DEFINITION------------------- units metal dimension 3 boundary s s p atom_style atomic read_data Cu.data pair_style eam/alloy pair_coeff * * Cu01.eam.alloy Cu #compute eng all pe/atom #compute 1 all stress/atom NULL #------------------------equilibrium--------------------- timestep 0.002 velocity all create 300.0 12345 min_style cg minimize 1e-18 1e-18 100000 100000 fix 1 all nve fix 2 all temp/rescale 10 300.0 300.0 10.0 1.0 dump 1 all custom 1000 ./initial/relax.*.dump id type x y z thermo 2000 thermo_style custom step lx ly lz press pe temp run 8000 undump 1 #-------------------------SHEAR--------------------------------- reset_timestep 0 timestep 0.002 dump 2 all custom 1 ./config/shear.*.dump id type x y z #c_eng c_1 dump_modify 2 delay 8875 #thermo 100000 #thermo_style custom step temp ke pe press fix 3 all deform 1 z scale 0.92 remap x units box run 9001 |
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