| 查看: 342 | 回复: 0 | ||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者水壶呼呼将赠送您 5 个金币 | ||
[求助]
关于restart的问题
|
||
|
最近在使用restart时出现了一个比较问题，一直没想明白。有没有哪位大佬路过能帮忙看一下 有一组对比，分为A组B组。 A组计算过程：在一个in文件里包含弛豫和后续的计算。 B组计算过程：先弛豫，存一个restart二进制文件，再在一个in文件里将这个文件作为初始模型直接进行后续的计算。 具体代码如下： B组： 存restart文件 shell mkdir initial #--------------------------DEFINITION------------------- units metal dimension 3 boundary s s p atom_style atomic read_data Cu.data pair_style eam/alloy pair_coeff * * Cu01.eam.alloy Cu #------------------------equilibrium--------------------- timestep 0.002 velocity all create 300.0 12345 min_style cg minimize 1e-18 1e-18 100000 100000 fix 1 all nve fix 2 all temp/rescale 10 300.0 300.0 10.0 1.0 dump 1 all custom 8000 ./initial/relax.*.dump id type x y z run 8000 undump 1 write_restart ./initial/restart.equil 计算过程 shell mkdir config read_restart restart.equili pair_style eam/alloy pair_coeff * * Cu01.eam.alloy Cu reset_timestep 0 timestep 0.002 dump 2 all custom 1 ./config/shear.*.dump id type x y z #c_eng c_1 dump_modify 2 delay 8875 fix 3 all deform 1 z scale 0.92 remap x units box run 9001 ----------------------------------------------------------------------------------------------- A组 shell mkdir initial shell mkdir config #--------------------------DEFINITION------------------- units metal dimension 3 boundary s s p atom_style atomic read_data Cu.data pair_style eam/alloy pair_coeff * * Cu01.eam.alloy Cu #compute eng all pe/atom #compute 1 all stress/atom NULL #------------------------equilibrium--------------------- timestep 0.002 velocity all create 300.0 12345 min_style cg minimize 1e-18 1e-18 100000 100000 fix 1 all nve fix 2 all temp/rescale 10 300.0 300.0 10.0 1.0 dump 1 all custom 1000 ./initial/relax.*.dump id type x y z thermo 2000 thermo_style custom step lx ly lz press pe temp run 8000 undump 1 #-------------------------SHEAR--------------------------------- reset_timestep 0 timestep 0.002 dump 2 all custom 1 ./config/shear.*.dump id type x y z #c_eng c_1 dump_modify 2 delay 8875 #thermo 100000 #thermo_style custom step temp ke pe press fix 3 all deform 1 z scale 0.92 remap x units box run 9001 |
回复此楼» 猜你喜欢
另一半是老师会加分哦
已经有6人回复
-
南林海归博士首聘期 没拿到国自然，被降级后自杀
已经有28人回复
-
导师这样说到底有没有机会啊………
已经有6人回复
-
宋凯
已经有8人回复
-
国自然青基把共同第一作者标成了唯一第一作者
已经有4人回复
-
河南工业大学过年开学后，就不让用国基金报账，这合法合规吗？
已经有37人回复
-
或许不关于爱情的
已经有68人回复
-
连续3年国社科青年本子都没中，今年最后一次青年了，写本子完全浪费时间
已经有8人回复
-
投稿竟然倒在了Scientific Reports上。
已经有14人回复
-
网传南京林业大学加拿大博士首聘期不合格，自杀
已经有29人回复
80