24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1066  |  回复: 1
【悬赏金币】回答本帖问题,作者mpiyq将赠送您 5 个金币

mpiyq

新虫 (初入文坛)

[求助] 模拟水蒸气凝结为液滴的表面张力

希望控制压力为0,但是fix             3  all  press/berendsen  iso  0.0 0.0 1000.0 这个命令一直跑不下去,希望有大神指导一下!

下面是我的凝结成为液滴部分in文件
#   in file for water molecule SPC/E model


echo      screen
units                 real
atom_style        full
boundary         p p p

bond_style       harmonic
angle_style       harmonic
pair_style         lj/charmm/coul/long   9.0 10.0 10.0
pair_modify     mix  arithmetic tail yes
kspace_style    ewald  0.0001

#创建原子
lattice  sc  4
region    box  block 0 10 0 10 0 10
create_box   2 box   bond/types 1   angle/types 1   extra/bond/per/atom 2       extra/angle/per/atom 2          extra/special/per/atom 2   
molecule                SPCE  mol.SPCE   

create_atoms      0 box  mol SPCE 10 units lattice

#相互作用
pair_coeff        1 1 0.1553  3.166
pair_coeff        * 2 0.000  0.000
bond_coeff      1      1000    1.0
angle_coeff      1     100     109.47

#mass
mass  1  15.9994
mass  2  1.008

#MD   setting
neighbor       2.0   bin
neigh_modify       delay  0 every  2   check  yes
timestep         1.0

thermo           100
thermo_style   custom   step  temp pe ke press pxx pyy pzz vol lx ly lz
minimize       1e-4 1e-6 10000 10000
reset_timestep   0



#预平衡
velocity           all  create  200.0  54654
fix                          1   all   shake  0.0001  50  0  b  1  a  1 mol SPCE
dump              Dump all custom 5000 NVT.lammpstrj  id  type x y z

## 稳定压力在0,z方向不控压,盒子尺寸不变,跑足够长时间,达到压力和温度平衡
fix             3  all  press/berendsen  iso  0.0 0.0 1000.0
run            10000
unfix          3


fix               4   all   nvt    temp   300  300  100.0
run             10000
reset_timestep   0
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

郭倪倪倪倪

铁虫 (小有名气)

我也在做这个,请问您做出来了吗
2楼2022-07-20 13:43:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 mpiyq 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
信息提示
请填处理意见