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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 融合蛋白linker设计
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x第四人称

新虫 (小有名气)

[求助] 融合蛋白linker设计 已有1人参与

在设计亚细胞定位实验方案，现在被linker的设计卡住了。
目标是定位真菌中的一类次级代谢产物的合成位点，方案是在合成这种物质的聚酮合酶的N端或者C端连接上一个EGFP。
现在的问题是，这个蛋白非常大，基因有8个kb，表达出来的蛋白有2600多个氨基酸。
中间肯定要加一个linker，目前查了一些资料，好几个在线设计linker的软件都已经停服了。
目前不知道是选柔性还是刚性的linker，还有更进一步的linker长度实在是没查到资料。
大佬们给点建议。谢谢！！！

@biostar2009 @飞约疯人院 @wizardfan @youlinglyw 发自小木虫Android客户端
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1楼 2021-03-19 09:32:37
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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲，勿施于人

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
linker一般就搞几个几个GS, GGS或GGGGS之类的重复序列就好了，没必要那么复杂
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x第四人称
The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
2楼2021-03-21 12:24:45
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x第四人称

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by fuyuandj86 at 2021-03-21 12:24:45
linker一般就搞几个几个GS, GGS或GGGGS之类的重复序列就好了，没必要那么复杂

多谢大佬
linker的长度是要连接的蛋白越长就要越长吗
有没有什么确定长度的标准。

发自小木虫Android客户端
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3楼2021-03-22 09:23:09
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