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如何用gaussian view 给每个原子设定不同的基组已有1人参与
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| 如何用gaussian view 给每个原子设定不同的基组。想要对分子吸附金属进行sers分析。但不知道如何分别的待测分子和金属团簇设定不同的基组。还有待测分子与金属团簇吸附的键怎么表示 |
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paramecium86
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+10 2021-03-16 17:08:45
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zhou2009: 金币+10 2021-03-16 17:08:45
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关于基组的问题可以直接用自定义基组的方式定义。高斯中既可以用原子的种类 也可以用分子中各个原子的的序号给不同的原子用不同的基组。比如下面例子中的苯酚 比如我想让苯环上的c 和 h 还有oh上的 o h 分别都是不同的基组 可以写成如下 %chk=d:\bz_oh_hybrid_basis.chk # b3lyp/genecp opt title card required 0 1 c -0.16903625 -0.55266579 0.00221280 c 1.22612375 -0.55266579 0.00221280 c 1.92366175 0.65508521 0.00221280 c 1.22600775 1.86359421 0.00101380 c -0.16881725 1.86351621 0.00053480 c -0.86641825 0.65531021 0.00153080 h -0.71879525 -1.50498279 0.00266280 h 1.77563175 -1.50517879 0.00352780 h 3.02334175 0.65516521 0.00284680 h -0.71893925 2.81579721 -0.00041820 h -1.96602225 0.65549321 0.00135080 o 1.94147582 3.10174018 0.00093708 h 2.10101280 3.37960484 -0.90401551 c 0 6-31g(d) **** 10 11 7 8 9 0 6-31+g(d,p) **** o 0 def2tzvp **** 13 0 aug-cc-pvtz **** 这样就可以做到 不同种类的原子比如 c 和 o用不同的基组 也可以对于 同一个种类的原子 但是处于不同位置 用它们的序号给它们用不一样的基组。如果有ecp 那么ecp的部分也是同理。用序号或者原子在这分子中的序号来设定不同的基组。 至于键 高斯中的键本事并无化学含义 所以你可以按照你自己的想法随意画上去就可以。你可以在它们之间设置虚线之类的。 |
2楼2021-03-16 11:32:41