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hjsjs

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于高斯优化后键的改变和离子与中性混合物的电荷表征问题

1. 最近做高斯优化嘌呤环，可是优化后用gaussview观察却发现发生某些地方的双键移位到其他位置，而本身变化成单键，甚至键断裂，请问怎么解决这个问题 ？

2。当离子与中性分子放一起的时候，比如碳正离子与中性分子，如何具体表征这个ion-molecular complex中碳正离子带正一价电荷，而不是整个混合物体系带正一价电荷?

3. 另外结构复杂的正离子，比如正苯胺离子与同样结构复杂的中性嘌呤分子放在一起，方位应该如何合理设计

[ Last edited by hjsjs on 2009-8-3 at 22:47 ]
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1楼 2009-08-03 02:23:17
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mengfc

金虫 (正式写手)
第二个问题，我也很想知道答案~
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2楼2009-08-03 06:55:10
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hjsjs

铜虫 (正式写手)
希望高手回答呀
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3楼2009-08-03 22:45:33
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recoli

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
hjsjs(金币+1):谢谢参与
hjsjs(金币+1,VIP+0): 8-4 07:23
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 8-4 20:21
1。可能是你的结构有问题，核对一下杂环上的氢。

2。用Mulliken电荷算一下不就行了。或者你用ESP电荷。总之正电荷集中在碳正离子上，这个没有问题。

3。为什么要把它们放一起，想要研究正离子和那个基团的相互作用。这个问题想好了，就知道该怎么摆放分子了。
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4楼2009-08-03 23:10:40
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tanlaixun

禁言 (知名作家)
★
hjsjs(金币+1):谢谢参与
本帖内容被屏蔽
5楼2009-08-03 23:39:28
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cihinustc

★
hjsjs(金币+1):谢谢参与
等待高手
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6楼2009-08-04 09:26:19
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mengfc

金虫 (正式写手)
★
hjsjs(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by hjsjs at 2009-8-3 22:45:
希望高手回答呀

第二个问题的意思是在计算之前如何设置使碳原子具有正一价？
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7楼2009-08-04 10:11:17
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mengfc

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by hjsjs at 2009-8-3 22:45:
1。可能是你的结构有问题，核对一下杂环上的氢。

2。用Mulliken电荷算一下不就行了。或者你用ESP电荷。总之正电荷集中在碳正离子上，这个没有问题。

3。为什么要把它们放一起，想要研究正离子和那个基团的相互作用。这个问题想好了，就知道该怎么摆放分子了。  

第二个问题是如何在计算之前使碳原子具有正一价？
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8楼2009-08-04 10:12:43
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recoli

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-4 22:35
第二个问题不用设置。只要结构正确，总电荷为1，计算结果会告诉你碳正离子就是正一价。
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9楼2009-08-04 21:47:00
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huanghs50

铁虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
mengfc，你按照 recoli 的方法去验证了吗？
那个碳正离子是正一价吗？
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10楼2009-08-05 11:13:18
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