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求助---高斯计算锂离子的单点能已有1人参与
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  小白用高斯计算Li离子的单点能量。总是在一开始就报错，请高手指导提交计算的文件 %nprocshared=24 %mem=4GB %chk=C:\Users\Administrator\Desktop\LiDFAMB-binding energy\energy-li.chk # b3lyp/6-31g(d) LiDFAMB.mol 1 2 Li -0.32861354 0.74565452 -0.12995346 1 log文件后面几排 ****************************************** Gaussian 16: ES64L-G16RevC.01 3-Jul-2019 28-Feb-2021 ****************************************** %nprocshared=24 Will use up to 24 processors via shared memory. %mem=4GB %chk=C:\Users\Administrator\Desktop\LiDFAMB-binding energy\energy-li.chk ntrex1 服务器输入和 提示yhrun -N 1 -n 1 -c 24 g16 energy-li.gjf ntrex1: Bad file descriptor Error: segmentation violation rax 0000000000000000, rbx 00000000ffffffff, rcx ffffffffffffffff rdx 0000000000004874, rsp 00007fff7b5d3028, rbp 00007fff7b5d3170 rsi 000000000000000b, rdi 0000000000004874, r8 0000000000000020 r9 0000000000000401, r10 00007fff7b5d2db0, r11 0000000000000206 r12 0000000000000001, r13 0000000004f967a8, r14 fffffffff8010000 r15 0000000000010000 sh: addr2line: command not found /lib64/libpthread.so.0() [0x392220f710] sh: addr2line: command not found /lib64/libc.so.6(kill+0x7) [0x3921a32c07] sh: addr2line: command not found /WORK/sysu_mxiao_1/g16root/g16/l1.exe() [0x4b777a] sh: addr2line: command not found /WORK/sysu_mxiao_1/g16root/g16/l1.exe() [0x4d7923] yhrun: error: cn9651: task 0: Exited with exit code 1 [sysu_mxiao_1@lon61 ~/LP/LiDFAMB-binding energy]$ |
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paramecium86
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6楼2021-03-01 17:29:28
paramecium86
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【答案】应助回帖
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提示的错误是因为 你在 %chk 之后写的路径 还是windows下的模式 什么c盘之类的。这个根本不是linux文件系统下的写法。既然是在linux平台上计算 就应该用linux的路径。 其次 你的这个电荷和自选多重度也有问题。你设置的是 1 2， 但是 Li+ 离子 不会是 2重态的 |
2楼2021-02-28 17:12:47
3楼2021-03-01 09:00:36
paramecium86
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| 见我这个教程 http://muchong.com/t-14242735-1 1.2节的内容。有如何判断一个分子或者原子的自旋多重度。 |
4楼2021-03-01 09:12:16
5