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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 为什么乳杆菌基因组抽提出来时三条带？
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安静的位置i

金虫 (小有名气)

[交流] 为什么乳杆菌基因组抽提出来时三条带？

我重复了两次基因组抽提的实验，结果都是一样的，每次都有三条带，大小分别在10000bp以上，1700bp，1000bp处，而且下面的两条小带反而更加亮，是基因组降解了吗？具体见下图，这是什么原因呢？如何解决？  
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1楼 2009-07-30 13:49:46
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安静的位置i

金虫 (小有名气)
不知图能不能看到，发到附件里看行不行。
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2楼2009-07-30 13:52:55
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jdklgjldg

木虫 (正式写手)
★
安静的位置i(金币+1,VIP+0): 7-31 17:11
是基因组断裂了，处理中导致的
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我的目标:诺贝尔医学与生理学奖
3楼2009-07-30 14:21:47
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holyala

木虫 (著名写手)

砖家
嗯，个人认为楼上是正解...
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4楼2009-07-30 14:39:48
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695

木虫 (职业作家)
恩，基因组断裂的缘故
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5楼2009-07-30 14:44:18
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安静的位置i

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by jdklgjldg at 2009-7-30 14:21:
是基因组断裂了，处理中导致的

啊，我动作很轻柔啊，程序也是按照说明书做的，而且这个图是两次重复的，结果一摸一样。会不会是溶菌酶后水浴半小时时间太长了？还是蛋白酶K后水浴半小时时间太长的缘故？
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6楼2009-07-30 16:38:51
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献
★ ★
安静的位置i(金币+2,VIP+0): 7-31 17:09
应该不是基因组断裂了,断裂也不会断裂的这么整齐吧,像酶切过的一样.敢问你,知道这个菌中有质粒存在么?

不过你提取的DNA量有点低.最上面那条带太弱了.

[ Last edited by brightfuture01 on 2009-7-30 at 16:49 ]
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The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
7楼2009-07-30 16:47:58
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安静的位置i

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2009-7-30 16:47:
应该不是基因组断裂了,断裂也不会断裂的这么整齐吧,像酶切过的一样.敢问你,知道这个菌中有质粒存在么?

不过你提取的DNA量有点低.最上面那条带太弱了.

[ Last edited by brightfuture01 on 2009-7-30 at 16 ...

是啊，我也怀疑过是不是这个菌里面有质粒，这个菌是我买来的一株罗伊氏乳杆菌，罗伊氏有两株菌测了序，但是好像不是这株，所以我也不知道这株有没有质粒，如何判断是不是质粒呢？
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8楼2009-07-30 17:02:55
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shensc727

金虫 (小有名气)
★ ★
安静的位置i(金币+2,VIP+0): 7-31 17:11
我也认为是有质粒存在！
你可以重新培养一下菌，向培养基中加一些常用的抗生素，如氨苄，G418等，再做个对照，看看菌长的有什么区别！一般有质粒的话，肯定能某种抗性的！
仅供参考！
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9楼2009-07-30 17:57:31
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安静的位置i

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by shensc727 at 2009-7-30 17:57:
我也认为是有质粒存在！
你可以重新培养一下菌，向培养基中加一些常用的抗生素，如氨苄，G418等，再做个对照，看看菌长的有什么区别！一般有质粒的话，肯定能某种抗性的！
仅供参考！

我也不能确定是否有质粒，我再查查相关文献吧，谢谢！
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10楼2009-07-31 15:47:15
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