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安静的位置i

金虫 (小有名气)

[交流] 为什么乳杆菌基因组抽提出来时三条带?

我重复了两次基因组抽提的实验,结果都是一样的,每次都有三条带,大小分别在10000bp以上,1700bp,1000bp处,而且下面的两条小带反而更加亮,是基因组降解了吗?具体见下图,这是什么原因呢?如何解决?  
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安静的位置i

金虫 (小有名气)

不知图能不能看到,发到附件里看行不行。
2楼2009-07-30 13:52:55
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jdklgjldg

木虫 (正式写手)


安静的位置i(金币+1,VIP+0): 7-31 17:11
是基因组断裂了,处理中导致的
我的目标:诺贝尔医学与生理学奖
3楼2009-07-30 14:21:47
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holyala

木虫 (著名写手)

砖家

嗯,个人认为楼上是正解...
4楼2009-07-30 14:39:48
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695

木虫 (职业作家)

恩,基因组断裂的缘故
5楼2009-07-30 14:44:18
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安静的位置i

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by jdklgjldg at 2009-7-30 14:21:
是基因组断裂了,处理中导致的

啊,我动作很轻柔啊,程序也是按照说明书做的,而且这个图是两次重复的,结果一摸一样。会不会是溶菌酶后水浴半小时时间太长了?还是蛋白酶K后水浴半小时时间太长的缘故?
6楼2009-07-30 16:38:51
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

★ ★
安静的位置i(金币+2,VIP+0): 7-31 17:09
应该不是基因组断裂了,断裂也不会断裂的这么整齐吧,像酶切过的一样.敢问你,知道这个菌中有质粒存在么?

不过你提取的DNA量有点低.最上面那条带太弱了.

[ Last edited by brightfuture01 on 2009-7-30 at 16:49 ]
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
7楼2009-07-30 16:47:58
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安静的位置i

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2009-7-30 16:47:
应该不是基因组断裂了,断裂也不会断裂的这么整齐吧,像酶切过的一样.敢问你,知道这个菌中有质粒存在么?

不过你提取的DNA量有点低.最上面那条带太弱了.

[ Last edited by brightfuture01 on 2009-7-30 at 16 ...

是啊,我也怀疑过是不是这个菌里面有质粒,这个菌是我买来的一株罗伊氏乳杆菌,罗伊氏有两株菌测了序,但是好像不是这株,所以我也不知道这株有没有质粒,如何判断是不是质粒呢?
8楼2009-07-30 17:02:55
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shensc727

金虫 (小有名气)

★ ★
安静的位置i(金币+2,VIP+0): 7-31 17:11
我也认为是有质粒存在!
你可以重新培养一下菌,向培养基中加一些常用的抗生素,如氨苄,G418等,再做个对照,看看菌长的有什么区别!一般有质粒的话,肯定能某种抗性的!
仅供参考!
9楼2009-07-30 17:57:31
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安静的位置i

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by shensc727 at 2009-7-30 17:57:
我也认为是有质粒存在!
你可以重新培养一下菌,向培养基中加一些常用的抗生素,如氨苄,G418等,再做个对照,看看菌长的有什么区别!一般有质粒的话,肯定能某种抗性的!
仅供参考!

我也不能确定是否有质粒,我再查查相关文献吧,谢谢!
10楼2009-07-31 15:47:15
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