| 查看: 217 | 回复: 1 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
chenggong2008新虫 (小有名气)
|
[交流]
【原创】Energy difference between successive steps in dynamics is greater than t
|
||
|
Dynamics: Energy difference between successive steps in dynamics is greater than the user defined variable DEVIATION, 5000.000 这个问题在我的机子上出现了几天？小弟现在把解决心得说出来听听。希望大家今后可以少走弯路。 1 当最初我出现这个问题的时候，我到网上搜了搜答案。网上有两个版本：首先，在dynamics的时候，调整小一点timesteps 由默认的1fs调整到0.5fs，第二，在NVT ensenmble中，调大energy convergence 这个我不建议，我个人觉得这影响精度。 2.我照着网上做了，但是还是没有解决问题。仔细分析原因，原来是minimizer 没有在局部找到能量最低点，在这里我设置成5000步的iteration都没有收敛，方法是用的最速下降法。后来改为用newton方法的BFGS算法成 3.minimizer 收敛后，我才dynamics，仍然采用nvt ensemble，energy diviation 采用5000 kal/mol,（默认值），把timesteps调小到0.5fs。结果收敛。 [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:32 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
[复试调剂]西南科技大学国防/材料导师推荐
已经有6人回复
-
化学工程321分求调剂
已经有12人回复
-
211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自动化所实习
已经有4人回复
-
材料专硕326求调剂
已经有5人回复
-
东南大学364求调剂
已经有5人回复
-
国自科面上基金字体
已经有7人回复
-
药学383 求调剂
已经有4人回复
-
286求调剂
已经有5人回复
-
085601求调剂
已经有3人回复
-
302求调剂
已经有5人回复
2楼2009-08-09 21:24:33
20